RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 ECE1P42892 770 aa27.03■■□□□ 1.92
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NEDD8-201ENST00000250495 MICALL2Q8IY33 904 aa27.03■■□□□ 1.92
NEDD8-201ENST00000250495 COL4A1P02462 1669 aa27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-201ENST00000250495 G3V3G9 751 aa27.02■■□□□ 1.92
NEDD8-201ENST00000250495 SLC4A2P04920 1241 aa27.02■■□□□ 1.92
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NEDD8-201ENST00000250495 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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NEDD8-201ENST00000250495 CDC37L1Q7L3B6 337 aa27.02■■□□□ 1.92
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NEDD8-201ENST00000250495 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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NEDD8-201ENST00000250495 USP48Q86UV5 1035 aa26.94■■□□□ 1.9
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NEDD8-201ENST00000250495 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
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NEDD8-201ENST00000250495 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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NEDD8-201ENST00000250495 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.85■■□□□ 1.89
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NEDD8-201ENST00000250495 HUNKP57058 714 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 DLK2Q6UY11 383 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 SULF1Q8IWU6 871 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 C2orf69Q8N8R5 385 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.84■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 USP17L8P0C7I0 530 aa26.83■■□□□ 1.89
NEDD8-201ENST00000250495 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.83■■□□□ 1.89
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