RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 TFCP2Q12800 502 aa24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 NLRP10Q86W26 655 aa24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 MPNDQ8N594 471 aa24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 RAD50Q92878 1312 aa24.02■■□□□ 1.44
VGF-201ENST00000249330 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 EP400Q96L91 3159 aa24.01■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ARID3AQ99856 593 aa24.01■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 STX6O43752 255 aa23.99■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SNX14Q9Y5W7 946 aa23.99■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SGSM2O43147 1006 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SMIM5Q71RC9 77 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TTC14Q96N46 770 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 SYT1P21579 422 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 AK2P54819 239 aa23.98■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 F13A1P00488 732 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 LRRC24Q50LG9 513 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 KDM4AO75164 1064 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 FAM177BA6PVY3 158 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 FIBPO43427 364 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 TNNI3KQ59H18 835 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 CNTROBQ8N137 903 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 KLHL34Q8N239 644 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 GPATCH3Q96I76 525 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.96■■□□□ 1.43
VGF-201ENST00000249330 RUFY3Q7L099 469 aa23.95■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.95■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
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VGF-201ENST00000249330 NUP98P52948 1817 aa23.94■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.94■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 PRDM4Q9UKN5 801 aa23.94■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 SEPT12Q8IYM1 358 aa23.93■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 RASEFQ8IZ41 740 aa23.93■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 CAMTA2O94983 1202 aa23.93■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 TIMM10P62072 90 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 PLCB2Q00722 1185 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 SUSD4Q5VX71 490 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.92■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 EYA2O00167 538 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 CSF1RP07333 972 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.91■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
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VGF-201ENST00000249330 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.9■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 GREM2Q9H772 168 aa23.9■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 TPM3P06753 285 aa23.9■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 KIF3AQ9Y496 699 aa23.9■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
VGF-201ENST00000249330 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.89■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 GJB2P29033 226 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 TSC1Q92574 1164 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 ATRNO75882 1429 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 EVI5LQ96CN4 794 aa23.88■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 ITGA6P23229 1130 aa23.87■■□□□ 1.41
VGF-201ENST00000249330 CTSWP56202 376 aa23.87■■□□□ 1.41
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