RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 IGSF1Q8N6C5 1336 aa7.33□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 GNA11P29992 359 aa7.32□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.32□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 STX1AQ16623 288 aa7.31□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.31□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.31□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 MEIS3Q99687 375 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PLVAPQ9BX97 442 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 ALDH1B1P30837 517 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 TUBB2AQ13885 445 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 RGS22Q8NE09 1264 aa7.3□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 C8orf58Q8NAV2 365 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.3□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.3□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 KAT14Q9H8E8 782 aa7.3□□□□□ -1.24
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SETX-201ENST00000224140 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 RILPL1Q5EBL4 403 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CCDC102BQ68D86 513 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 CABP5Q9NP86 173 aa7.29□□□□□ -1.24
SETX-201ENST00000224140 SLAIN2Q9P270 581 aa7.29□□□□□ -1.24
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