RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ZyxQ62523 564 aa34.9■■■■□ 3.18
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Setdb1O88974 1307 aa34.9■■■■□ 3.18
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psd3Q2PFD7 1037 aa34.88■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vps54Q5SPW0 977 aa34.88■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccne2Q9Z238 404 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 EspnlQ3UYR4 1005 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Egfem1Q8C088 590 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scn11aQ9R053 1765 aa34.87■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rnf123Q5XPI3 1314 aa34.86■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TnksQ6PFX9 1320 aa34.86■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CalcaP70160 136 aa34.86■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IntuQ059U7 942 aa34.86■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nlrp9aQ66X03 949 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp4r3bQ922R5 820 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trpc5Q9QX29 975 aa34.85■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppfia1B2RXQ2 1266 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prl3d1P18121 224 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sptlc3Q8BG54 563 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CpvlQ9D3S9 478 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Npc1l1Q6T3U4 1333 aa34.84■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ube3bQ9ES34 1070 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Popdc2Q9ES82 367 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slfn1Q9Z0I7 337 aa34.83■■■■□ 3.17
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppm1gQ61074 542 aa34.81■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx11Q6AXC6 880 aa34.81■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ufl1Q8CCJ3 793 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Golim4Q8BXA1 655 aa34.8■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Osbpl5Q9ER64 874 aa34.8■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ParvgQ9ERD8 331 aa34.8■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rabep1O35551 862 aa34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Celf1P28659 486 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nme8Q715T0 586 aa34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bmp2kQ91Z96 1138 aa34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 StrcQ8VIM6 1809 aa34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bend4P86174 541 aa34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx46Q569Z5 1032 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Il17raQ60943 864 aa34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 HlfQ8BW74 295 aa34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tango6Q8C3S2 1079 aa34.78■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP34.77■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cfap70D3YVL2 1141 aa34.76■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Emilin1Q99K41 1017 aa34.76■■■■□ 3.16
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GorabQ8BRM2 368 aa34.75■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WaslQ91YD9 501 aa34.75■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Izumo3A6PWV3 263 aa34.74■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc14a2Q8R4T9 930 aa34.74■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa34.74■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nup98Q6PFD9 1816 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rhbdl3P58873 404 aa34.73■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Top1mtQ8R4U6 593 aa34.73■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Erc1Q99MI1 1120 aa34.72■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa34.71■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10093D3YYI8 482 aa34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MccE9PWI3 1003 aa34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Casp1P29452 402 aa34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NfixP70257 488 aa34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp2b4Q6Q477 1205 aa34.7■■■■□ 3.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prl7d1P04769 244 aa34.7■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gja5Q01231 358 aa34.7■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Best3Q6H1V1 669 aa34.7■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp2ab1S4R196 498 aa34.7■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mdm2P23804 489 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc7a3P70423 618 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ltv1Q6NSQ7 470 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nup188Q6ZQH8 1759 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q8C6G1 249 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mtfr1lQ9CWE0 289 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Irs4Q9Z0Y7 1216 aa34.68■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa34.67■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rad50P70388 1312 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WdpcpQ8C456 722 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col4a5Q63ZW6 1691 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A0A1W2P7S8 802 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MecomP14404 1042 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pcsk7Q61139 770 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nek11Q8C0Q4 628 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam84aQ9D650 292 aa34.66■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NpeppsQ11011 920 aa34.65■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mroh6V9GX81 722 aa34.65■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP34.64■■■■□ 3.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd63A2ARS0 390 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hap1O35668 628 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Anapc15P60007 132 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map10Q8BJS7 891 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 IarsQ8BU30 1262 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ipo9Q91YE6 1041 aa34.63■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm5592Q3V0A6 857 aa34.6■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubxn10Q8BG34 277 aa34.6■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dok7Q18PE0 504 aa34.59■■■■□ 3.13
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ell2Q3UKU1 639 aa34.59■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.1 ms