RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049575.7

Cltb-201, Transcript of Clathrin light chain B, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cltb, Length 1,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tmem143Q8VD26 458 aa21.03■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa21.03■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Col3a1P08121 1464 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Hoxd11P23813 323 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Casp1P29452 402 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 VegfbP49766 207 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tmem67Q8BR76 992 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Shtn1Q8K2Q9 631 aa21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Cltb-201ENSMUST00000049575 NrapQ80XB4 1728 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 GabreA2AMW3 916 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tgfb1i1Q62219 461 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Znf219Q6IQX8 726 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Peak1Q69Z38 1735 aa21.01■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Prl3d2F6R3P9 224 aa21■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa21■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Csrnp1P59054 583 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Terf1P70371 421 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ccdc51Q3URS9 406 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Chmp3Q9CQ10 224 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Osbpl5Q9ER64 874 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Apbb1Q9QXJ1 710 aa20.99■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gm2163Q6PCY5 473 aa20.98■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa20.98■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 LratQ9JI60 231 aa20.98■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Kifc2O08672 792 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 D1Pas1P16381 660 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Llgl2Q3TJ91 1027 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cnot7Q60809 285 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rab3gap1Q80UJ7 981 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Phf23Q8BSN5 401 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ascc2Q91WR3 749 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 SisF8VQM5 1818 aa20.97■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Usp17lbE9Q9U0 468 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Magea8O89012 320 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mxd3Q80US8 206 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Dhx38Q80X98 1228 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Micall1Q8BGT6 870 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Plekho1Q9JIY0 408 aa20.96■□□□□ 0.95
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ftl2P49945 183 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 VgfQ0VGU4 617 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Large2Q5XPT3 690 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mum1Q6DID5 682 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fchsd1Q6PFY1 688 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Fzd9Q9R216 592 aa20.95■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 GabrdP22933 449 aa20.94■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 NyxP83503 476 aa20.94■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ppp1r1bQ60829 194 aa20.94■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Myh15E9Q264 1925 aa20.94■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rps12P63323 132 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 WasP70315 520 aa20.93■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Plekhf1Q3TB82 279 aa20.93■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ankrd44B2RXR6 993 aa20.92■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Slc44a4Q91VA1 707 aa20.92■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Maco1Q7TQE6 664 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ppil2Q9D787 521 aa20.91■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 AppP12023 770 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cap1P40124 474 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rhbdl3P58873 404 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Agtpbp1Q641K1 1218 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Znf18Q810A1 556 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Zkscan8Q8BSL0 588 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Myh4Q5SX39 1939 aa20.9■□□□□ 0.94
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Q3UJP5 209 aa20.89■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 WdpcpQ8C456 722 aa20.89■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa20.88■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Nell2Q61220 819 aa20.88■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tmem130Q6NXM3 419 aa20.88■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Sult6b1P0CC03 303 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 LeprP48356 1162 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ankrd13cQ3UX43 541 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 EspnlQ3UYR4 1005 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Atg9aQ68FE2 551 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Q8C5K5 320 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 ParvgQ9ERD8 331 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Usp34Q6ZQ93 3582 aa20.87■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Eya2O08575 532 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Plbd2Q3TCN2 594 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Oog3Q3UWY1 500 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 RubcnQ80U62 956 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ndfip2Q91ZP6 311 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tceal9Q9DD24 104 aa20.86■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Brpf1B2RRD7 1212 aa20.85■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Pde8bE9Q4S1 865 aa20.85■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Cxcl9P18340 126 aa20.85■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Prkar2bP31324 416 aa20.84■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Trappc12Q8K2L8 797 aa20.84■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Tmem79Q9D709 391 aa20.84■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Arfgef1G3X9K3 1846 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Stk36Q69ZM6 1316 aa20.83■□□□□ 0.93
Cltb-201ENSMUST00000049575 Ets1P27577 440 aa20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.4 ms