RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GUSB	P08236	651 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CALCB	P10092	127 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	DPF1	Q92782	380 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CYTIP	O60759	359 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TM4SF4	P48230	202 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CHST11	Q9NPF2	352 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	BMP2	P12643	396 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MOB3A	Q96BX8	217 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ITGAM	P11215	1152 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MOB3B	Q86TA1	216 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	RASD2	Q96D21	266 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CDK2AP1	O14519	115 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TNFSF11	O14788	317 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CACNG3	O60359	315 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PMPCA	Q10713	525 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TVP23C	Q96ET8	276 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	HES4	Q9HCC6	221 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GAST	P01350	101 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR10A3	P58181	314 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	HMGN3	Q15651	99 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SPP1	P10451	314 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	NPY4R	P50391	375 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GPRIN2	O60269	458 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC35E2	P0CK97	266 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2M7	Q8NG81	312 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ELK1	P19419	428 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TBXA2R	P21731	343 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MDGA2	Q7Z553	956 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	EMC6	Q9BV81	110 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB22A	Q9UL26	194 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ADAM12	O43184	909 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CTNS	O60931	367 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	RFC3	P40938	356 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	BANF2	Q9H503	90 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672		M0QYG6	137 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SOX18	P35713	384 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	BPIFB3	P59826	476 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR51F2	Q8NH61	342 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC38A5	Q8WUX1	472 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SARG	Q9BW04	601 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	USP22	Q9UPT9	525 aa		12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	CYS1	Q717R9	158 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	APH1B	Q8WW43	257 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	ST8SIA4	Q92187	359 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	POFUT1	Q9H488	388 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		12.73	□□□□□ -0.37
NRXN1-222	ENST00000625672	GHSR	Q92847	366 aa		12.73	□□□□□ -0.37

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