RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597552.1

TIMM50-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM50, Length 369 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-208ENST00000597552 EFCAB1Q9HAE3 211 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 ADA2Q9NZK5 511 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 ABCD2Q9UBJ2 740 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 DUSP13Q9UII6 198 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa8.59□□□□□ -1.03
TIMM50-208ENST00000597552 A0A1W2PPL8 197 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 A0A1W2PPW3 197 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 EFCAB9A8MZ26 197 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 M0R233 179 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MGRN1O60291 552 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SNX3O60493 162 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 NCR1O76036 304 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 FARS2O95363 451 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 STAMBPO95630 424 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 IGF2P01344 180 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 IGHMP01871 453 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 HPXP02790 462 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SCG5P05408 212 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 NAT2P11245 290 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 APEHP13798 732 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF32P17041 273 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CCNOP22674 350 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 IGFBP5P24593 272 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LSP1P33241 339 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 THBS2P35442 1172 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 GLRXP35754 106 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SLC9A3P48764 834 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 RPL27P61353 136 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 GNGT1P63211 74 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 PRKCDQ05655 676 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CCNIQ14094 377 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SGCAQ16586 387 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ELFN2Q5R3F8 820 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 C10orf128Q5T292 105 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CYB5R2Q6BCY4 276 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 OAFQ86UD1 273 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF519Q8TB69 540 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SNX18Q96RF0 628 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 NARFLQ9H6Q4 476 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CDH20Q9HBT6 801 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TMEM160Q9NX00 188 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SLC7A8Q9UHI5 535 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.58□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 WIPF1O43516 503 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SYNGR3O43761 229 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LMX1BO60663 402 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LCKP06239 509 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SRD5A1P18405 259 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LAP3P28838 519 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 RBMXP38159 391 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MAGEB1P43366 347 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 HSF2Q03933 536 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SEC23BQ15437 767 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SLC36A2Q495M3 483 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MESTQ5EB52 335 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 FGD3Q5JSP0 725 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 GLYATQ6IB77 296 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CPLX4Q7Z7G2 160 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 OR52J3Q8NH60 311 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 RASD2Q96D21 266 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 Q96M85 177 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SPAG4Q9NPE6 437 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 ARL8BQ9NVJ2 186 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TAAR3PQ9P1P4 343 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.57□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.56□□□□□ -1.045e-6■■■■□ 22.8
TIMM50-208ENST00000597552 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.56□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.56□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.56□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.56□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.56□□□□□ -1.04
TIMM50-208ENST00000597552 GMNCA6NCL1 334 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms