RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591762.1

SPHK1-209, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPHK1, Length 2,502 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-209ENST00000591762 ADH7P40394 386 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RAP2BP61225 183 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 EBPQ15125 230 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 PHYHIPQ92561 330 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RXFP3Q9NSD7 469 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 CACNA1CQ13936 2221 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FER1L5A0AVI2 2057 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ALPK2Q86TB3 2170 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TIAF1O95411 115 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ITPKBP27987 946 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 BTN1A1Q13410 526 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 WBP2NLQ6ICG8 309 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MARCH3Q86UD3 253 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 EID2Q8N6I1 236 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF563Q8TA94 476 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 LRFN5Q96NI6 719 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 REG4Q9BYZ8 158 aa16■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR2M5A3KFT3 312 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SIGLEC6O43699 453 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SUSD5O60279 629 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RLN1P04808 185 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RAB40ALP0C0E4 278 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 IL12BP29460 328 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 DHODHQ02127 395 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 C2orf68Q2NKX9 166 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TUSC1Q2TAM9 212 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TMEM71Q6P5X7 295 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 UBALD2Q8IYN6 164 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SLC43A2Q8N370 569 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MIB2Q96AX9 1013 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR6C1Q96RD1 312 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FXYD6Q9H0Q3 95 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SLITRK2Q9H156 845 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 A0A1W2PQM1 296 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 H0YC42 278 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 CCL7P80098 99 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 Q499Y3 187 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 LIPNQ5VXI9 398 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FAM220AQ7Z4H9 259 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 DEFB123Q8N688 67 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.99■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MEIS3P1A6NDR6 274 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MFSD2BA6NFX1 497 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 H7C1C5 153 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 HCRTR2O43614 444 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SULT1B1O43704 296 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 PPM1BO75688 479 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 GLCEO94923 617 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 WISP1O95388 367 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 NMBP08949 121 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 AQP2P41181 271 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 H2BFSP57053 126 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 B2MP61769 119 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 LCN6P62502 163 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 HLA-BQ31612 363 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF440Q8IYI8 595 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR4D10Q8NGI6 311 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 WWTR1Q9GZV5 400 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 FRRS1LQ9P0K9 344 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 COPS7AQ9UBW8 275 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 LGALS8O00214 317 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 TOR1AO14656 332 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 OR2A4O95047 310 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ZP3P21754 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 ZNF117Q03924 483 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 PLCXD2Q0VAA5 305 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.98■□□□□ 0.15
SPHK1-209ENST00000591762 COX15Q7KZN9 410 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms