RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583007.2

PKIB-208, Transcript of cAMP-dependent protein kinase inhibitor beta, human

TSL 5

Gene PKIB, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKIB-208	ENST00000583007	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	USF3	Q68DE3	2245 aa		4.27	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	DSCAM	O60469	2012 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007		A0A087WZY1	265 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	DUXA	A6NLW8	204 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	FBP2	O00757	339 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	AP3D1	O14617	1153 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF264	O43296	627 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	KIAA0513	O60268	411 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TPST1	O60507	370 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	EDF1	O60869	148 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	NDUFS7	O75251	213 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	STX11	O75558	287 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TGDS	O95455	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TK1	P04183	234 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	IL6	P05231	212 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PRG2	P13727	222 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CAPN3	P20807	821 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	RYK	P34925	604 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	KRT20	P35900	424 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CDKN1A	P38936	164 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	AQP5	P55064	265 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CARD18	P57730	90 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	KCNJ10	P78508	379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	H3F3A	P84243	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	FOXF1	Q12946	379 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SELPLG	Q14242	412 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PON3	Q15166	354 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	EFNB3	Q15768	340 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	GSTA3	Q16772	222 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	VRK2	Q86Y07	508 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	OR10D3	Q8NH80	312 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ARL5B	Q96KC2	179 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	MAGEB18	Q96M61	343 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CCDC106	Q9BWC9	280 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PINK1	Q9BXM7	581 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ACER3	Q9NUN7	267 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	VAPA	Q9P0L0	249 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007		A0A096LPI6	279 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SLC22A20	A6NK97	555 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF587B	E7ETH6	402 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	RFXANK	O14593	260 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	TNFSF11	O14788	317 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	LYPD3	O95274	346 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CRH	P06850	196 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	PRSS1	P07477	247 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	IDO1	P14902	403 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ZNF17	P17021	662 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	GPX2	P18283	190 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	ASCL1	P50553	236 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	P2RY4	P51582	365 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	CRYBA2	P53672	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	NR1H2	P55055	460 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PKIB-208	ENST00000583007	RCAN2	Q14206	197 aa		4.25	□□□□□ -1.73

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