RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569222.5

KIFC3-233, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 3

Gene KIFC3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-233	ENST00000569222	STAMBP	O95630	424 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	PPP1R3D	O95685	299 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	GAST	P01350	101 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC6A6	P31641	620 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	CDA	P32320	146 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF84	P51523	738 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	HGFAC	Q04756	655 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	CCNI	Q14094	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SAMD8	Q96LT4	415 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SNX18	Q96RF0	628 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SYT4	Q9H2B2	425 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	NTN4	Q9HB63	628 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		11.65	□□□□□ -0.54
KIFC3-233	ENST00000569222	ARHGEF9	O43307	516 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	MGRN1	O60291	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ENTPD5	O75356	428 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CST1	P01037	141 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF35	P13682	527 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ERF	P50548	548 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NPRL3	Q12980	569 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF544	Q6NX49	715 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NUP37	Q8NFH4	326 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NSMAF	Q92636	917 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	DCTN6	O00399	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	SOCS2	O14508	198 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	XKRY	O14609	159 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CRYAA	P02489	173 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	SERPINA5	P05154	406 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	SCG5	P05408	212 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	GAA	P10253	952 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CD79A	P11912	226 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NPR2	P20594	1047 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	TTK	P33981	857 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CAPZA2	P47755	286 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RAB1A	P62820	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CBX1	P83916	185 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	PIGF	Q07326	219 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ETFDH	Q16134	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RBP7	Q96R05	134 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	DDO	Q99489	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	FEV	Q99581	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	POLE4	Q9NR33	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CA10	Q9NS85	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	DNAJB9	Q9UBS3	223 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	IDH3B	O43837	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	SNAP29	O95721	258 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RAB36	O95755	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CST2	P09228	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	GSTM3	P21266	225 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	MSR1	P21757	451 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	LAP3	P28838	519 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	PTH2R	P49190	550 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	RAB39A	Q14964	217 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	ADIPOQ	Q15848	244 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	MST1L	Q2TV78	715 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	SLC36A2	Q495M3	483 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		11.62	□□□□□ -0.55
KIFC3-233	ENST00000569222	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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