RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566784.5

PKD1-231, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-231	ENST00000566784	GPRIN2	O60269	458 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SNAP29	O95721	258 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SEMG1	P04279	462 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ITGA2	P17301	1181 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PCSK6	P29122	969 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GPR4	P46093	362 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	VLDLR	P98155	873 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PLP2	Q04941	152 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MSMP	Q1L6U9	139 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	C16orf89	Q6UX73	402 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CDRT15	Q96T59	188 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.93	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SYNGR3	O43761	229 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	AHCYL1	O43865	530 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CD14	P08571	375 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CDA	P32320	146 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	LIMS1	P48059	325 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MNAT1	P51948	309 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	KRT72	Q14CN4	511 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FGD3	Q5JSP0	725 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NSMAF	Q92636	917 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PYURF	Q96I23	114 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FUZ	Q9BT04	418 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		11.92	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784		M0R233	179 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	DYNC1I1	O14576	645 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ARPC2	O15144	300 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PTP4A3	O75365	173 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ADRA2A	P08913	450 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CST2	P09228	141 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	OMP	P47874	163 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SMIM11A	P58511	58 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ERVK-25	P63136	954 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	HSF2	Q03933	536 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SGCA	Q16586	387 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	DEFB107A	Q8IZN7	70 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		11.91	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	XKRY	O14609	159 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	DIRAS1	O95057	198 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NDUFB2	O95178	105 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CCL2	P13500	99 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	DAO	P14920	347 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ZNF32	P17041	273 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GIF	P27352	417 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	APLNR	P35414	380 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	NR4A2	P43354	598 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MXRA7	P84157	204 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	SEC23B	Q15437	767 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	FITM2	Q8N6M3	262 aa		11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
PKD1-231	ENST00000566784	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		11.9	□□□□□ -0.5

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