RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF121	Q9H920	327 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		18.72	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNGR3	O43761	229 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CCL2	P13500	99 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	DAO	P14920	347 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	GIF	P27352	417 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	CD47	Q08722	323 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	THEM4	Q5T1C6	240 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	SYT3	Q9BQG1	590 aa		18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	18.71	■□□□□ 0.59
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PRQ8	180 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R233	179 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	STAMBP	O95630	424 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	NR2C1	P13056	603 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR4	P46093	362 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	DGCR6	Q14129	220 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM27B	Q5VT28	67 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF786	Q8N393	782 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF148	Q8N7C7	305 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FNDC8	Q8TC99	324 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	NSMAF	Q92636	917 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ADA2	Q9NZK5	511 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		18.7	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PTH	P01270	115 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GGTLC2	Q14390	218 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CARTPT	Q16568	116 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RBP7	Q96R05	134 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FZR1	Q9UM11	496 aa		18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200		A6NIZ1	184 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PTP4A3	O75365	173 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM157B	P0CG42	384 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	HSD17B1	P14061	328 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF32	P17041	273 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RHCE	P18577	417 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDH3B1	P43353	468 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	LIMS1	P48059	325 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP1B	P61224	184 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RAP1A	P62834	184 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	GNGT1	P63211	74 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TPK1	Q9H3S4	243 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CD300A	Q9UGN4	299 aa		18.68	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SEMG1	P04279	462 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF250	P15622	560 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	UCP2	P55851	309 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ERVK-25	P63136	954 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PLP2	Q04941	152 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RIN1	Q13671	783 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SGCA	Q16586	387 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBED5	Q49AG3	693 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM122B	Q7Z309	247 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FUZ	Q9BT04	418 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH20	Q9HBT6	801 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM160	Q9NX00	188 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP13	Q9UII6	198 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		18.67	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	CD14	P08571	375 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF23	P17027	643 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	OMP	P47874	163 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG4	Q00888	419 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC23B	Q15437	767 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	RRM2B	Q7LG56	351 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
PPP4C-205	ENST00000563200	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		18.66	■□□□□ 0.58

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