RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-209ENST00000547201 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ZNF620Q6ZNG0 422 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 EID3Q8N140 333 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RFLNBQ8N5W9 214 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SYT14Q8NB59 555 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR2T29Q8NH02 315 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 OR5J2Q8NH18 312 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MFSD8Q8NHS3 518 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 FANK1Q8TC84 345 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ASB10Q8WXI3 467 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RND1Q92730 232 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MCUR1Q96AQ8 359 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 S100PBPQ96BU1 408 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SAMD8Q96LT4 415 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 Q96M85 177 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 SLC29A1Q99808 456 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 KATNB1Q9BVA0 655 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 LIME1Q9H400 295 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MED20Q9H944 212 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 C12orf10Q9HB07 376 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MRGBPQ9NV56 204 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 RPS6KA6Q9UK32 745 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.84□□□□□ -1.63
USP25-209ENST00000547201 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 A0A1B0GUH1 482 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 AQP12BA6NM10 295 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 DEFB108AA8MXU0 73 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 EFCAB9A8MZ26 197 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 M0R3G1 203 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 TNFRSF11BO00300 401 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 EBAG9O00559 213 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 BHLHE40O14503 412 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 SOCS2O14508 198 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 TRMUO75648 421 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 MPZL1O95297 269 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 CST1P01037 141 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 GYPBP06028 91 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 PGA4P0DJD7 388 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 PGA3P0DJD8 388 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ADORA3P0DMS8 318 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 RAP2AP10114 183 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 CTLA4P16410 223 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 COX5AP20674 150 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 RPS27P42677 84 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 RBM34P42696 430 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 HTR3AP46098 478 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 OR3A2P47893 321 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 MTNR1BP49286 362 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ASCL1P50553 236 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 MNAT1P51948 309 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 SLC35A1P78382 337 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 IL1RL1Q01638 556 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 PUDPQ08623 228 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ST3GAL3Q11203 375 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 PMS2P3Q13401 168 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ATP6AP1Q15904 470 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 AQP12AQ8IXF9 295 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 WDR31Q8NA23 367 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 NRG4Q8WWG1 115 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 NABP1Q96AH0 204 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 MBOAT4Q96T53 435 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 FEVQ99581 238 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 SFXN3Q9BWM7 321 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 PRRG4Q9BZD6 226 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 OR52D1Q9H346 318 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 MAGIXQ9H6Y5 334 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 FKRPQ9H9S5 495 aa4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP25-209ENST00000547201 NDE1Q9NXR1 346 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms