RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFAB1O14561 156 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERPINA1P01009 418 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TGFAP01135 160 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LCKP06239 509 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL27P61353 136 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKCDQ05655 676 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMODQ06828 376 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OAFQ86UD1 273 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGFN1Q86VF2 1251 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM162AQ96A26 154 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBP7Q96R05 134 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GMNCA6NCL1 334 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FFAR1O14842 300 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APEX1P27695 318 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 APLNRP35414 380 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAD52P43351 418 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NKPD1Q17RQ9 610 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALKBH6Q3KRA9 238 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HACD2Q6Y1H2 254 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RRM2BQ7LG56 351 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf40Q8WZ69 217 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSH2DQ96JZ2 352 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNX18Q96RF0 628 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALG12Q9BV10 488 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPR160Q9UJ42 338 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNAP29O95721 258 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAT2P11245 290 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NCK1P16333 377 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCNOP22674 350 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGFBP5P24593 272 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UCP2P55851 309 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIN1Q13671 783 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THEM4Q5T1C6 240 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SYNPRQ8TBG9 265 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMTM5Q96DZ9 223 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TAAR3PQ9P1P4 343 aa20.01■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A087WUU8 490 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LILRA1O75019 489 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLPTM1O96005 669 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPXP02790 462 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TACSTD2P09758 323 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF32P17041 273 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSME3P61289 254 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKDD1AQ495B1 522 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELFN2Q5R3F8 820 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM205BPQ63HN1 556 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBPL2Q6SJ96 375 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLDN22Q8N7P3 220 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR13C2Q8NGS9 318 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF519Q8TB69 540 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FNDC8Q8TC99 324 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RDH5Q92781 318 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NABP1Q96AH0 204 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOX7Q9BT81 388 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MXRA5Q9NR99 2828 aa20■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NIZ1 184 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RNF212BA8MTL3 300 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHMP01871 453 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL8A2P25067 703 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STOMP27105 288 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPL4P36578 427 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC9A3P48764 834 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAP1BP61224 184 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERVS71-1P61550 626 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAP1AP62834 184 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIP10Q15642 601 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM120AOSQ5T036 256 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL17RELQ6ZVW7 336 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC75AQ8NAA5 344 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNX33Q8WV41 574 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPS1Q92902 700 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TSPAN32Q96QS1 320 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM107BQ9H098 131 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPS6KA6Q9UK32 745 aa19.99■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF250P15622 560 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNF1AP20823 631 aa19.98■□□□□ 0.79
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL2RGP31785 369 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms