RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 GRK5P34947 590 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CRISP1P54107 249 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 PIGFQ07326 219 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 DAG1Q14118 895 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 HIST3H3Q16695 136 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM236Q5W0B7 351 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC22A24Q8N4F4 322 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC38A2Q96QD8 506 aa11.73□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 RNF121Q9H920 327 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 RAB36O95755 333 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-HP01893 362 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 TP53P04637 393 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 HMGN1P05114 100 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 RAD23AP54725 363 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 NPRL3Q12980 569 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CRMP1Q14194 572 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf128Q5T292 105 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM4DQ6B0I6 523 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC16A14Q7RTX9 510 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 TSSK2Q96PF2 358 aa11.72□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNS3Q9BQ31 491 aa11.72□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM183AA6NL82 134 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 A6NNC1 897 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 ETFDHQ16134 617 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 GSG1Q2KHT4 349 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC36A2Q495M3 483 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 BEX5Q5H9J7 111 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 LPCAT4Q643R3 524 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SSX8Q7RTT4 187 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 GALNT4Q8N4A0 578 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR31Q8NA23 367 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10H5Q8NGA6 315 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 OR6K6Q8NGW6 343 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 OR2T4Q8NH00 348 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 EMC7Q9NPA0 242 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.71□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.71□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 UBL3O95164 117 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 ALPLP05186 524 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 GYPBP06028 91 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 PATE4P0C8F1 98 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 MSR1P21757 451 aa11.7□□□□□ -0.54
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PGGT1B-204ENST00000503638 PYCR1P32322 319 aa11.7□□□□□ -0.54
PGGT1B-204ENST00000503638 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
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