RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2B8PP59922 312 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRKCDQ05655 676 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GJB7Q6PEY0 223 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DOK6Q6PKX4 331 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2Z1Q8NG97 314 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2G2Q8NGZ5 317 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LMO3Q8TAP4 145 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TFAP2CQ92754 450 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ELMOD3Q96FG2 381 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TCTN2Q96GX1 697 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR2A14Q96R47 310 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HCN3Q9P1Z3 774 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PTPRDP23468 1912 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTS20P59510 1910 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NMBP08949 121 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RANP62826 216 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KLRB1Q12918 225 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 XAF1Q6GPH4 301 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C16orf46Q6P387 395 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD17CQ6PCB6 329 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C10orf107Q8IVU9 208 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SVBPQ8N300 66 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CLEC1AQ8NC01 280 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR1K1Q8NGR3 316 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 THAP6Q8TBB0 222 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PIGXQ8TBF5 258 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OSTF1Q92882 214 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC6A7Q99884 636 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC32Q9BV29 185 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 WWTR1Q9GZV5 400 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IL22Q9GZX6 179 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 LYRM4Q9HD34 91 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HRASLSQ9HDD0 168 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CYSLTR2Q9NS75 346 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CUTCQ9NTM9 273 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PNPOQ9NVS9 261 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 VCANP13611 3396 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 A0A0G2JNG1 304 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PRSS37A4D1T9 235 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR5H14A6NHG9 310 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 IFITM10A6NMD0 228 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 COLCA2A8K830 154 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 C9J4A7 227 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FABP7O15540 132 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 TSPAN13O95857 204 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BPGMP07738 259 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXB5P09067 269 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 HOXA5P20719 270 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OTX2P32243 289 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RGRP47804 291 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RAG2P55895 527 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A3Q00325 362 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 KIR2DS5Q14953 304 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ADPRMQ3LIE5 342 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ASPHD2Q6ICH7 369 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 PTOV1Q86YD1 416 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 OR52B4Q8NGK2 314 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF133Q8WVZ7 376 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MOCOSQ96EN8 888 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 DGAT2Q96PD7 388 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 MCEEQ96PE7 176 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 CD180Q99467 661 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 NPAS2Q99743 824 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 AGPAT1Q99943 283 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCG5Q9H222 651 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGGTB-213ENST00000496055 RNF121Q9H920 327 aa4.14□□□□□ -1.75
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