RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	KRT36	O76013	467 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CCNB2	O95067	398 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF35	P13682	527 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LAP3	P28838	519 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SDHA	P31040	664 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	HOXC12	P31275	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ADAM8	P78325	824 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TAF11	Q15544	211 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GSG1	Q2KHT4	349 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	DTX2	Q86UW9	622 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4K13	Q8NH42	304 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FBXW5	Q969U6	566 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NMNAT3	Q96T66	252 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FEV	Q99581	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CCL19	Q99731	98 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NUAK2	Q9H093	628 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ACAN	P16112	2415 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM129	A0AVI4	362 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR6C68	A6NDL8	312 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GPRIN2	O60269	458 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF32	P17041	273 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SGCA	Q16586	387 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MEP1B	Q16820	701 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PERP	Q96FX8	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	REEP1	Q9H902	201 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	IL20	Q9NYY1	176 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487		A0A1W2PPL8	197 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487		A6NIZ1	184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ANOS1	P23352	680 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	TTK	P33981	857 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	THBS4	P35443	961 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	PTH2R	P49190	550 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	RAP1B	P61224	184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ERVS71-1	P61550	626 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	RAP1A	P62834	184 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	PSG4	Q00888	419 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ADIPOQ	Q15848	244 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	THEM4	Q5T1C6	240 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	VHLL	Q6RSH7	139 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	LRP11	Q86VZ4	500 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	OR6V1	Q8N148	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	IFT27	Q9BW83	186 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	POLE4	Q9NR33	117 aa		12.77	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ARPC3	O15145	178 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC16A7	O60669	478 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ATP5H	O75947	161 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	LY6H	O94772	140 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	GAA	P10253	952 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	APEX1	P27695	318 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	NOS3	P29474	1203 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC6A6	P31641	620 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	ARR3	P36575	388 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM27B	Q5VT28	67 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		12.76	□□□□□ -0.37
CIZ1-222	ENST00000491487	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.76	□□□□□ -0.37

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms