RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	SRD5A1	P18405	259 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	MAK	P20794	623 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	CDA	P32320	146 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC7A2	P52569	658 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HSF2	Q03933	536 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	PHC2	Q8IXK0	858 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NRM	Q8IXM6	262 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	GEMIN6	Q8WXD5	167 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	RHCG	Q9UBD6	479 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PGAP2-223	ENST00000489571	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	GMNC	A6NCL1	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571		J3KTA2	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CXCR6	O00574	342 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	NME4	O00746	187 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	FFAR1	O14842	300 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC22	O60826	627 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	NCR1	O76036	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF682	O95780	498 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CLPTM1	O96005	669 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	LCK	P06239	509 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF32	P17041	273 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	HNF1A	P20823	631 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ACHE	P22303	614 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	COL8A2	P25067	703 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	THBS2	P35442	1172 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CDH15	P55291	814 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	SELENOV	P59797	346 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TRAM2	Q15035	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CR1L	Q2VPA4	569 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	NSMAF	Q92636	917 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RDH5	Q92781	318 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	C1orf159	Q96HA4	380 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ANK2	Q01484	3957 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	GSTA4	O15217	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	APLNR	P35414	380 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RAD52	P43351	418 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	UCP2	P55851	309 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CTXN1	P60606	82 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	PRKCD	Q05655	676 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	FHL1	Q13642	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CCNI	Q14094	377 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	SGCA	Q16586	387 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	IFI44L	Q53G44	452 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CBLL1	Q75N03	491 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	YIPF5	Q969M3	257 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	RBP7	Q96R05	134 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	C17orf100	A8MU93	164 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	PRSS23	O95084	383 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	STOM	P27105	288 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PGAP2-223	ENST00000489571	MAGEB1	P43366	347 aa		13.5	□□□□□ -0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms