RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGEF9O43307 516 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RAMP1O60894 148 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 PFDN1O60925 122 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A12O75746 678 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 ARL6IP5O75915 188 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 NUDT14O95848 222 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 HPP00738 406 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 RAF1P04049 648 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF17P17021 662 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 SPATA2Q9UM82 520 aa5.04□□□□□ -1.6
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JMP0 313 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0X1KG70 313 aa5.03□□□□□ -1.6
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