RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCRBV5S2A0A599 114 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHRS12A0PJE2 317 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRSS37A4D1T9 235 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H3BSA7 217 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNFRSF11BO00300 401 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTP4A3O75365 173 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HLA-HP01893 362 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOD3P08294 240 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CST2P09228 141 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD99P14209 185 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSR1P21757 451 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCSK6P29122 969 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRABP1P29762 137 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GSSP48637 474 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPOXP50336 477 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALK2Q01415 458 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPRL3Q12980 569 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DAG1Q14118 895 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLOT2Q14254 428 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D28Q2M2D7 210 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM27BQ5VT28 67 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBPL2Q6SJ96 375 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP2R1Q6VVX0 501 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RINLQ6ZS11 566 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYT14Q8NB59 555 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2T29Q8NH02 315 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PERPQ96FX8 193 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF75AQ96N20 296 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THTPAQ9BU02 230 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 REEP1Q9H902 201 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF224Q9NZL3 707 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MOKQ9UQ07 419 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKBP7Q9Y680 259 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 V9GYQ6 96 aa7.44□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIVEP2P31629 2446 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C12orf71A8MTZ7 269 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 J3QW42 95 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACOT8O14734 319 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ICMTO60725 284 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC14L2O76054 403 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DIRAS1O95057 198 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCNB2O95067 398 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX5BP10606 129 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NR4A1P22736 598 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBG1P23258 451 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APLNRP35414 380 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLRXP35754 106 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINF1P36955 418 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GIPRP48546 466 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SELENOVP59797 346 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HSF2Q03933 536 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RUNX1T1Q06455 604 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPOCK1Q08629 439 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCRN3Q0VDG4 424 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX10Q12887 443 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BNIP1Q12981 228 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB35Q15286 201 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC23BQ15437 767 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RFX4Q33E94 735 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PGBD2Q6P3X8 592 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARL9Q6T311 187 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 B3GLCTQ6Y288 498 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BIVMQ86UB2 503 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SKA3Q8IX90 412 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR52J3Q8NH60 311 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NABP1Q96AH0 204 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C18orf12Q96KH6 178 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR52D1Q9H346 318 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF121Q9H920 327 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH20Q9HBT6 801 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOX3Q9HBY0 568 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms