RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 GINS1Q14691 196 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RCN1Q15293 331 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ACSM5Q6NUN0 579 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SLC27A4Q6P1M0 643 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CIB1Q99828 191 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 OSBPL10Q9BXB5 764 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CADP27708 2225 aa26.26■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 BAG2O95816 211 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CAPZA2P47755 286 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CDK5Q00535 292 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NCMAPQ5T1S8 102 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FGFBP3Q8TAT2 258 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RERGLQ9H628 205 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SIAEQ9HAT2 523 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 LRBAP50851 2863 aa26.25■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPR1 153 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RENP00797 406 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CRISP1P54107 249 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 OR6V1Q8N148 313 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CYB561A3Q8NBI2 242 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FN3KQ9H479 309 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SEC61A2Q9H9S3 476 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NOX3Q9HBY0 568 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 MGRN1O60291 552 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 PATE4P0C8F1 98 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NPR2P20594 1047 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 GRK5P34947 590 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 PIGFQ07326 219 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 BSPH1Q075Z2 132 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SGCAQ16586 387 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM236Q5W0B7 351 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM200AQ86VY9 491 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SLC37A3Q8NCC5 494 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FOXN4Q96NZ1 517 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 B9D1Q9UPM9 204 aa26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPL8 197 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 M0R1B8 84 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FARS2O95363 451 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SCG5P05408 212 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CD79AP11912 226 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 IGFBP5P24593 272 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CRABP1P29762 137 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NR1H2P55055 460 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 KRTAP10-9P60411 292 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ESRRGP62508 458 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FBXW10Q5XX13 1052 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 MDP1Q86V88 176 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC18Q8N456 261 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 DCLRE1BQ9H816 532 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CMC2Q9NRP2 79 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 KLHL21Q9UJP4 597 aa26.23■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CBR1P16152 277 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 EPHA2P29317 976 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CRMP1Q14194 572 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FAM27BQ5VT28 67 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A19Q9HC21 320 aa26.22■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 EI24O14681 340 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV3-15P01624 115 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ALPLP05186 524 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ANPEPP15144 967 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 PAX7P23759 505 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 GSG1Q2KHT4 349 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM108Q6UXF1 575 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 SLC16A14Q7RTX9 510 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB46Q86UZ6 589 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CBR4Q8N4T8 237 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FAM169BQ8N8A8 192 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF75AQ96N20 296 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 POLE4Q9NR33 117 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 FKBP7Q9Y680 259 aa26.21■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 UBL3O95164 117 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 IGLV1-44P01699 117 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 CD40P25942 277 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 LAP3P28838 519 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RAB1AP62820 205 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 RIPK1Q13546 671 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 DAG1Q14118 895 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 DNM1P34Q6PK57 102 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 GLB1L2Q8IW92 636 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM204Q9BSN7 226 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 USE1Q9NZ43 259 aa26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa26.2■■□□□ 1.78
PKDCC-202ENST00000401498 PLAUP00749 431 aa26.2■■□□□ 1.78
PKDCC-202ENST00000401498 IFNGP01579 166 aa26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms