RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 AREGP15514 252 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 RFX3P48380 749 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PGFP49763 221 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.18□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 ORC5O43913 435 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 PPM1JQ5JR12 505 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MORN1Q5T089 497 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF605Q86T29 641 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 NPIPA1Q9UND3 350 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
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RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 PARGQ86W56 976 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR4N4Q8N0Y3 316 aa6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5D13Q8NGL4 314 aa6.17□□□□□ -1.42
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