RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 SHISA3A0PJX4 238 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 LHX2P50458 406 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 GLO1Q04760 184 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 FAM205BPQ63HN1 556 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00346Q8IVM7 164 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 YIPF7Q8N8F6 280 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 SLC26A10Q8NG04 563 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 HSD17B8Q92506 261 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 MCHR2Q969V1 340 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 IKZF2Q9UKS7 526 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 LIPGQ9Y5X9 500 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 METTL15A6NJ78 407 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 NPIPA2E9PIF3 369 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 NPIPA3F8WFD2 350 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 UPK3AO75631 287 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 WNT11O96014 354 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 IGHG1P01857 330 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 HLA-DPB1P04440 258 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 QDPRP09417 244 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 INHBBP09529 407 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 EDNRAP25101 427 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 CDAP32320 146 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 SDC2P34741 201 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 SELENOPP49908 381 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 CAV3P56539 151 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 HSF2Q03933 536 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 THEM4Q5T1C6 240 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 LIPNQ5VXI9 398 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 NOXO1Q8NFA2 376 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD4Q8TB40 342 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 BARHL1Q9BZE3 327 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 GALNT8Q9NY28 637 aa13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CASQ1-201ENST00000368078 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 WISP2O76076 250 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 VAMP5O95183 116 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD16AO95870 558 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 GAAP10253 952 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OPRL1P41146 370 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEB1P43366 347 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BMXP51813 675 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CLDN18P56856 261 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC10A1Q14973 349 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CDK5R1Q15078 307 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 HIST3H3Q16695 136 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 HYAL4Q2M3T9 481 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FAM27D1Q5T7N8 215 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CORO6Q6QEF8 472 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 IGFL2Q6UWQ7 119 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LRRN1Q6UXK5 716 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MCFD2Q8NI22 146 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 C11orf40Q8WZ69 217 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KCTD7Q96MP8 289 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KCNS3Q9BQ31 491 aa13.64□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPK0 400 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPL8 197 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF823P16415 610 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 GDI2P50395 445 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 BLVRAP53004 296 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 C3AR1Q16581 482 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 MOGQ16653 247 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF404Q494X3 552 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 GLB1L2Q8IW92 636 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR2M2Q96R28 347 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD6Q9BV23 337 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 SEC61A2Q9H9S3 476 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CENPBD1B2RD01 187 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 CDK2AP1O14519 115 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF432O94892 652 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 KRT8P05787 483 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 LAP3P28838 519 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TAS2R43P59537 309 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 POU4F3Q15319 338 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM178AQ8NBL3 297 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 PPP1R14AQ96A00 147 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DACH2Q96NX9 599 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ELOVL3Q9HB03 270 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 EMC7Q9NPA0 242 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FRRS1LQ9P0K9 344 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 WASF3Q9UPY6 502 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa13.63□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 RTTNQ86VV8 2226 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 FREM1Q5H8C1 2179 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF716A6NP11 495 aa13.62□□□□□ -0.23
CASQ1-201ENST00000368078 DNPH1O43598 174 aa13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms