RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365375.1

RNU6-728P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 728, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-728P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-728P-201ENST00000365375 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MEAF6Q9HAF1 191 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF492Q9P255 531 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAT4Q6V0I7 4981 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 NUP205Q92621 2012 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 LRP5LA4QPB2 252 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 F5H6K3 240 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MANBAO00462 879 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MFNGO00587 321 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 LANCL1O43813 399 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SSX5O60225 188 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 VPS26AO75436 327 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 REM1O75628 298 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FSTL3O95633 263 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 RAB3DO95716 219 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 AP2A1O95782 977 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CAPN1P07384 714 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CBR1P16152 277 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 NTF3P20783 257 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 IMPDH1P20839 514 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SSTR5P35346 364 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 OGDHQ02218 1023 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 HSF2Q03933 536 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 KLRC3Q07444 240 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 C1orf61Q13536 156 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR5I1Q13606 314 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PRPSAP1Q14558 356 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SS18Q15532 418 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PGGHGQ32M88 737 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZFAND6Q6FIF0 208 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PLET1Q6UQ28 207 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 EGFL6Q8IUX8 553 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PRSS58Q8IYP2 241 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 STXBP6Q8NFX7 210 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TTLQ8NG68 377 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MUC7Q8TAX7 377 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 KRT35Q92764 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MED8Q96G25 268 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CABS1Q96KC9 395 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 RIT2Q99578 217 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 EDEM2Q9BV94 578 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ACAT2Q9BWD1 397 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM117Q9H0C3 514 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MCCC2Q9HCC0 563 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ADAP2Q9NPF8 381 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 C21orf62Q9NYP8 219 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM47DPA6NHR8 397 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CEACAM18A8MTB9 384 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 AQP9O43315 295 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR1F1O43749 312 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ANGP03950 147 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MPV17P39210 176 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PRLHRP49683 370 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ACADVLP49748 655 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC9A3R2Q15599 337 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ORMDL2Q53FV1 153 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MPV17L2Q567V2 206 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TEX30Q5JUR7 227 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CATSPER4Q7RTX7 472 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MISPQ8IVT2 679 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CCDC65Q8IXS2 484 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC35F2Q8IXU6 374 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 CEP112Q8N8E3 955 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR10T2Q8NGX3 314 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 OR1F12Q8NHA8 337 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TMEM54Q969K7 222 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 PTX4Q96A99 478 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MRGPRFQ96AM1 343 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAM3DQ96BQ1 224 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 TIMM17AQ99595 171 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 DPH5Q9H2P9 285 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 SLC2A8Q9NY64 477 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 FETUBQ9UGM5 382 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 MGAT4BQ9UQ53 548 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-728P-201ENST00000365375 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms