RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 LACC1Q8IV20 430 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 OR10K1Q8NGX5 313 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 TXNL1O43396 289 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 MYF5P13349 255 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 SRP9P49458 86 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 HPSE2Q8WWQ2 592 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa20.52■□□□□ 0.88
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0D9SG52 128 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 M0R1B8 84 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 PPP3CBP16298 524 aa20.52■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 BTG2P78543 158 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 CORO6Q6QEF8 472 aa20.52■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A25Q6T423 547 aa20.52■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 CSF3RQ99062 836 aa20.52■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 PPP2CAP67775 309 aa20.51■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 OR6C65A6NJZ3 312 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 TNFRSF10CO14798 259 aa20.5■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 OR8G2PQ6IF36 304 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 PELI3Q8N2H9 469 aa20.5■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 DVL1O14640 695 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 FGF17O60258 216 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 ZMAT1Q5H9K5 638 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 CASP3P42574 277 aa20.49■□□□□ 0.87
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PTPRM-201ENST00000332175 WFDC8Q8IUA0 241 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 EGLN1Q9GZT9 426 aa20.49■□□□□ 0.87
PTPRM-201ENST00000332175 ETV7Q9Y603 341 aa20.49■□□□□ 0.87
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