RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318266.9

PTPRA-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRA, Length 3,219 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRA-202ENST00000318266 AMELYQ99218 206 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SLC6A7Q99884 636 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 COMMD4Q9H0A8 199 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 TXNL1O43396 289 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 BRINP1O60477 761 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GLCEO94923 617 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SNAPINO95295 136 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 HLA-DQA2P01906 255 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 TAS2R19P59542 299 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CXADRP78310 365 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SHHQ15465 462 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 RAB11BQ15907 218 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CDNFQ49AH0 187 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ARL11Q969Q4 196 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SEH1LQ96EE3 360 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CST11Q9H112 138 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 MPDZO75970 2070 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF208O43345 1280 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 RHOP08100 348 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SLC35G6P0C7Q6 338 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ADH5P11766 374 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ADAM8P78325 824 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 IL13RA1P78552 427 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SMCO1Q147U7 214 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OR52W1Q6IF63 320 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SLC29A4Q7RTT9 530 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ACBD4Q8NC06 268 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OR10G6Q8NH81 332 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GPR148Q8TDV2 347 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 LCN9Q8WX39 176 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 STARD5Q9NSY2 213 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 PRR13Q9NZ81 148 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DPP7Q9UHL4 492 aa8.75□□□□□ -1.01
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PTPRA-202ENST00000318266 TMED7Q9Y3B3 224 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 COL4A6Q14031 1691 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 MOSPD3O75425 235 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 VIPR2P41587 438 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ACTBP60709 375 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ACTG1P63261 375 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GFOD2Q3B7J2 385 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GLYATL3Q5SZD4 288 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 UQCC3Q6UW78 93 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OR52R1Q8NGF1 315 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OR5AP2Q8NGF4 316 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CMBLQ96DG6 245 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 C14orf79Q96F83 325 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CMKLR1Q99788 373 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 MRI1Q9BV20 369 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 UQCC1Q9NVA1 299 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DAPP1Q9UN19 280 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 RAB19A4D1S5 217 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 I3L1I5 382 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 B3GALT2O43825 422 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 IGKV1D-16P01601 117 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CD8AP01732 235 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 CTXN1P60606 82 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 PEA15Q15121 130 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 IRF4Q15306 451 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF77Q15935 545 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRA-202ENST00000318266 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.74□□□□□ -1.01
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