RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1031Q7TR87 336 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hs6st2Q80UW0 612 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NagpaQ8BJ48 517 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trmt6Q8CE96 497 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo45Q8K3B1 286 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plcz1Q8K4D7 647 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GpnmbQ99P91 574 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zmynd19Q9CQG3 227 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hcfc1r1Q9CYQ5 120 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpc2Q9D023 127 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930503E14RikQ9D583 177 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FtmtQ9D5H4 237 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstz1Q9WVL0 216 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Muc5acE9QAQ8 3455 aa11.52□□□□□ -0.56
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhox1B1APN4 224 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata6lB2RV46 347 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp870J3QMA4 560 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr190K7N5T5 307 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 MfngO09008 321 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Creg1O88668 220 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adh1P00329 375 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsx2P31316 305 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gch1Q05915 241 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10644Q3TZG3 87 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr140Q60878 302 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ly6eQ64253 130 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Doxl2Q6IMK7 723 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc6a5Q761V0 799 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gper1Q8BMP4 375 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl22Q8BU88 206 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dzank1Q8C008 778 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Emc1Q8C7X2 997 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr769Q8K501 312 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CthQ8VCN5 398 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam110cQ8VE94 421 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hrasls5Q9CPX5 270 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa5Q9D7I0 235 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhouQ9EQT3 261 aa11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cabin1G3X8Q1 2187 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm572B1ARY8 399 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf148G3X9R7 316 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20696H3BJN7 74 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef1a1P10126 462 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp13P10754 512 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bbs1Q3V3N7 593 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc5a6Q5U4D8 634 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fzd8Q61091 685 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam12Q61824 903 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RgmaQ6PCX7 454 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clba1Q8BHN9 321 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxw13Q8BI57 466 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fem1abQ8C0T1 654 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nupl2Q8CIC2 420 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RfesdQ8K2P6 157 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dcbld1Q9D4J3 503 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700080E11RikE9Q9G1 206 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r99H3BK37 856 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r45L7N2B5 852 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Clk1P22518 483 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hectd3Q3U487 861 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il12rb1Q60837 738 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxd3Q61060 465 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr304Q7TS03 333 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RflnaQ7TS73 204 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc34a3Q80SU6 601 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gadl1Q80WP8 550 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd11Q8BNW9 633 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl6Q8BVH9 282 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TigarQ8BZA9 269 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc38a1Q8K2P7 485 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acss1Q99NB1 682 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gid4Q9CPY6 217 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pfn4Q9D6I3 129 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc9a3r2Q9JHL1 337 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Decr2Q9WV68 292 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps13cQ8BX70 3748 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm364A2AFI6 671 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1107A2AVB8 312 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stpg3A2RSX4 306 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf217D3YYI7 515 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpd5D6MZJ6 483 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd4b5E9PYY6 479 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr610E9Q598 315 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ms4a7E9Q9V5 267 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 H2-M11F6U8V3 335 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P06336 421 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkcaP20444 672 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uck1P52623 277 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Col10a1Q05306 680 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Shisa3Q3UPR0 238 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr332Q5NC45 344 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EdnraQ61614 427 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrrn1Q61809 716 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp119bQ8K0G9 543 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tctn3Q8R2Q6 595 aa11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfc3Q8R323 356 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc2Q9CQP2 140 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.3 ms