RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sdc1P18828 311 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lsm5P62322 91 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr381Q5SSP0 311 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r196Q5SVD5 301 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr664Q7TRP5 306 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gucd1Q8BZI6 239 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nfatc4Q8K120 901 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Treml1Q8K558 317 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr161Q8VGB9 313 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr582Q8VGV9 319 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Steap1Q9CWR7 339 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Wdr55Q9CX97 388 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mpc2Q9D023 127 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam174aQ9D3L0 190 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sh3bgrlQ9JJU8 114 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 SptbP15508 2128 aa8.58□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3604A0A087WPN2 559 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cytl1A1E5L0 139 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fcrl6A1YIY0 268 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1097A2AVA9 315 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd209fD3Z1H5 274 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr620E9PZ66 313 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lrp3E9Q1T6 790 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr152G3X9L8 316 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a18J3QN01 344 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm21834J3QN05 151 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r88L7N1W8 857 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NfkbieO54910 364 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sod2P09671 222 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Smpdl3aP70158 445 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dcst1Q059Y8 732 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam187bQ0VAY3 358 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr165Q3V3A3 455 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Taar7fQ5QD08 358 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Taar7eQ5QD09 358 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Taar7bQ5QD11 358 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf235Q61116 645 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Il10raQ61727 575 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr137bQ8BNQ3 385 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr514Q8VFZ6 310 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr393Q8VGR6 312 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rab40bQ8VHP8 278 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acot7Q91V12 381 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Memo1Q91VH6 297 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nt5dc2Q91X76 390 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr101Q920Z0 308 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mrpl18Q9CQL5 180 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gabra4Q9D6F4 552 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Clec6aQ9JKF4 209 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lhx6Q9R1R0 363 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AsmtD3KU66 387 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r49D3Z6L3 852 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccdc188F6WEU2 249 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ccl26F8VQM2 93 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 P04213 122 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc10a2P70172 348 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Adra2aQ01338 450 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q5SPV6 233 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Foxc2Q61850 494 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr270Q7TS19 314 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 HeltQ7TS99 240 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp947Q8BIQ6 437 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Trmt10aQ8C1Z8 328 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mptx1Q8R1M8 219 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1079Q8VF52 315 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr659Q8VGV6 322 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ucn3Q924A4 164 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr642Q924X8 314 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxo36Q9CQ24 188 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prss30Q9QYZ9 310 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp942B8JJA7 486 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr893K7N678 312 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hoxa1P09022 331 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Spata6Q3U6K5 488 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 ArhgdigQ62160 225 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Faap24Q8BHL6 221 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxl14Q8BID8 400 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc5a8Q8BYF6 611 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam169bQ8CHT6 337 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cbr3Q8K354 277 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn1r83Q8R287 306 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ntng1Q8R4G0 539 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1110Q8VG38 312 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ms4a6cQ99N08 217 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pam16Q9CQV1 125 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nprl2Q9WUE4 380 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cst9Q9Z0H6 137 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cldn13Q9Z0S4 211 aa8.57□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm13212B1ASQ7 799 aa8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CapgP24452 352 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 S100a13P97352 98 aa8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bcl2a1cQ0P538 128 aa8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Uap1l1Q3TW96 507 aa8.56□□□□□ -1.04
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AktipQ64362 292 aa8.56□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.2 ms