RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629179.1

PNKP-223, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 4

Gene PNKP, Length 811 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-223	ENST00000629179	T-ENOL	P0DO92	83 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ITGA2	P17301	1181 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	CDA	P32320	146 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	THBS4	P35443	961 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SERPINF1	P36955	418 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SLC9A3	P48764	834 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF84	P51523	738 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ERVK-25	P63136	954 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	CD47	Q08722	323 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	RAB35	Q15286	201 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ADIPOQ	Q15848	244 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SPATS1	Q496A3	300 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZBED5	Q49AG3	693 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	C10orf128	Q5T292	105 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	BIVM	Q86UB2	503 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NSMAF	Q92636	917 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	HIVEP2	P31629	2446 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179		H7C417	338 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	PTP4A3	O75365	173 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	OR4A8	P0C604	315 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF35	P13682	527 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	OMP	P47874	163 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SPIB	Q01892	262 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	DAG1	Q14118	895 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ETFDH	Q16134	617 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	KRT80	Q6KB66	452 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NUP37	Q8NFH4	326 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF519	Q8TB69	540 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	RBP7	Q96R05	134 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	RNF121	Q9H920	327 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	RNF223	E7ERA6	249 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ENTPD5	O75356	428 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	GADD45G	O95257	159 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	LY6G6D	O95868	133 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SERPINA5	P05154	406 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	FABP3	P05413	133 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	BMP4	P12644	408 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ATP6V1B2	P21281	511 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	CALB2	P22676	271 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NR4A1	P22736	598 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	LIMS1	P48059	325 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	NUDT6	P53370	316 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SGCA	Q16586	387 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179		Q96M85	177 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	GPA33	Q99795	319 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		12.28	□□□□□ -0.44
PNKP-223	ENST00000629179	TMEM129	A0AVI4	362 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	UNC119B	A6NIH7	251 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179		A6NIZ1	184 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179		B9A039	149 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179		H7C1C5	153 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	PDE5A	O76074	875 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	LY6H	O94772	140 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	CD14	P08571	375 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	NPR2	P20594	1047 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	RRM2	P31350	389 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	SMIM11A	P58511	58 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	RAP1B	P61224	184 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	LCN6	P62502	163 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	RAP1A	P62834	184 aa		12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	12.27	□□□□□ -0.45
PNKP-223	ENST00000629179	MSMP	Q1L6U9	139 aa		12.27	□□□□□ -0.45

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