RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-209ENST00000620074 CA10Q9NS85 328 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF224Q9NZL3 707 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-209ENST00000620074 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa9.59□□□□□ -0.87
UBXN8-209ENST00000620074 TRAV27A0A087WT01 109 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 VSTM5A8MXK1 200 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 B9A039 149 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SEMG1P04279 462 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 GPR4P46093 362 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NUDT6P53370 316 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SMIM11AP58511 58 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CTXN1P60606 82 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RPL27P61353 136 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RAB1AP62820 205 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 VLDLRP98155 873 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 HGFACQ04756 655 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 PIGFQ07326 219 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RAB35Q15286 201 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 EFNB3Q15768 340 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SWI5Q1ZZU3 235 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FGD3Q5JSP0 725 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM53Q6P2H8 277 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 PODNL1Q6PEZ8 512 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SYT14Q8NB59 555 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 OR51A7Q8NH64 312 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FBXO17Q96EF6 278 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF75AQ96N20 296 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 C1orf198Q9H425 327 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NOX3Q9HBY0 568 aa9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 A6NIZ1 184 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 hCG_2039718K7EN88 272 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CDC42EP2O14613 210 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NDUFS7O75251 213 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 OR4A8P0C604 315 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NPR2P20594 1047 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CALB2P22676 271 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ACVR1BP36896 505 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SERPINF1P36955 418 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 LIMS1P48059 325 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 GIPRP48546 466 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 DSCR9P59020 149 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RAP1BP61224 184 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RAP1AP62834 184 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MYBPC1Q00872 1141 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CD47Q08722 323 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TNK1Q13470 666 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FHL1Q13642 323 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 DAG1Q14118 895 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ADIPOQQ15848 244 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MST1LQ2TV78 715 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SLC36A2Q495M3 483 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ZBED5Q49AG3 693 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MTX3Q5HYI7 312 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 DNM1P46Q6ZS02 220 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 JAZF1Q86VZ6 243 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SKA3Q8IX90 412 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ZNF519Q8TB69 540 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 NSL1Q96IY1 281 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 RBP7Q96R05 134 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 MUC13Q9H3R2 512 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FAM53CQ9NYF3 392 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SPEF1Q9Y4P9 236 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 V9GYQ6 96 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 ZFHX3Q15911 3703 aa9.57□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 B2RBV5 119 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SSX4O60224 188 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 DIRAS1O95057 198 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 GADD45GO95257 159 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SLC2A10O95528 541 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 PTHP01270 115 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 SERPINA5P05154 406 aa9.56□□□□□ -0.88
UBXN8-209ENST00000620074 FABP3P05413 133 aa9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms