RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM36Q9NQ86 728 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 A6NIZ1 184 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF724A8MTY0 619 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 K7EP13 123 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ARG1P05089 322 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 F13BP05160 661 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CD5P06127 495 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 C8AP07357 584 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 MMP2P08253 660 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 LIMS3P0CW19 117 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 LIMS4P0CW20 117 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SDHBP21912 280 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 OR1E2P47887 323 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 RPIAP49247 311 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 HERPUD1Q15011 391 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF774Q6NX45 483 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 LINC00471Q8N535 108 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 OR8U1Q8NH10 309 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 OR52I2Q8NH67 350 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CD300LFQ8TDQ1 290 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 HMGB4Q8WW32 186 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TMED6Q8WW62 240 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PIK3IP1Q96FE7 263 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TSSK3Q96PN8 268 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PHB2Q99623 299 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC6Q99741 560 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 C2orf78A6NCI8 922 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PRR33A8MZF0 331 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ANKRD66B4E2M5 251 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CYR61O00622 381 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR37L1O60883 481 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ARL6IP5O75915 188 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 BCHEP06276 602 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TAS2R43P59537 309 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 NTHL1P78549 312 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 HMGCS1Q01581 520 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ENPP2Q13822 863 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CEACAM19Q7Z692 300 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 FRMD1Q8N878 549 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 OR5AP2Q8NGF4 316 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 WWTR1Q9GZV5 400 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TDP1Q9NUW8 608 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 DKKL1Q9UK85 242 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A1W2PPE2 198 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF222A6NCQ9 220 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 NKX6-3A6NJ46 265 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 LRG1P02750 347 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 IFNA6P05013 189 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CD14P08571 375 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SOX18P35713 384 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL4P36578 427 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 DGKEP52429 567 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TAS2R19P59542 299 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TXNDC8Q6A555 127 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 SMARCD3Q6STE5 483 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 TTLL10Q6ZVT0 673 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-218ENST00000590367 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms