RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586900.1

PKN1-208, Transcript of protein kinase N1, human

TSL 3

Gene PKN1, Length 550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKN1-208	ENST00000586900	CDK5	Q00535	292 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	MYBPC1	Q00872	1141 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	PPA1	Q15181	289 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	PGGHG	Q32M88	737 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	TBRG1	Q3YBR2	411 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	OR4K13	Q8NH42	304 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	DDO	Q99489	341 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		10.8	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FAM221A	A4D161	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900		H7C1C5	153 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SLC2A10	O95528	541 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	BAG2	O95816	211 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	HMGN1	P05114	100 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ALPL	P05186	524 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ANPEP	P15144	967 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	NPR2	P20594	1047 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	IGFBP5	P24593	272 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	POU1F1	P28069	291 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CRABP1	P29762	137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	LCN6	P62502	163 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FMOD	Q06828	376 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	DAG1	Q14118	895 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	GINS1	Q14691	196 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	RCN1	Q15293	331 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	LEG1	Q6P5S2	330 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	KLHL24	Q6TFL4	600 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	NMNAT3	Q96T66	252 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CIB1	Q99828	191 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	TEX12	Q9BXU0	123 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SYT4	Q9H2B2	425 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SIAE	Q9HAT2	523 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CMC2	Q9NRP2	79 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FKBP7	Q9Y680	259 aa		10.79	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	IFNG	P01579	166 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CTLA4	P16410	223 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	RAD23A	P54725	363 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	BEX5	Q5H9J7	111 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CBR4	Q8N4T8	237 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	OR52N5	Q8NH56	324 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	EME1	Q96AY2	570 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	WAC	Q9BTA9	647 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	NUAK2	Q9H093	628 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	C8orf4	Q9NR00	106 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	B9D1	Q9UPM9	204 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.78	□□□□□ -0.68
PKN1-208	ENST00000586900	ABCA4	P78363	2273 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900		A0A096LPE4	126 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900		A0A1W2PPZ6	126 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900	OR6C68	A6NDL8	312 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900		A6NNC1	897 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900	ZAR1L	A6NP61	321 aa		10.77	□□□□□ -0.69
PKN1-208	ENST00000586900	EI24	O14681	340 aa		10.77	□□□□□ -0.69

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