RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229		M0R1B8	84 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	IMPA2	O14732	288 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	BAG2	O95816	211 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	REN	P00797	406 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CD79A	P11912	226 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PRF1	P14222	555 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SSX8	Q7RTT4	187 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	21.82	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	BHLHE40	O14503	412 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ARPC3	O15145	178 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	TXNDC12	O95881	172 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	OSM	P13725	252 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CDA	P32320	146 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CENPA	P49450	140 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	DAP	P51397	102 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SGCA	Q16586	387 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	C10orf128	Q5T292	105 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NMNAT3	Q96T66	252 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		21.81	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CACNA1D	Q01668	2161 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SIAH2	O43255	324 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	IDH3B	O43837	385 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A7	O60669	478 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	FAHD1	Q6P587	224 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC18	Q8N456	261 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SH3GL3	Q99963	347 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	FN3K	Q9H479	309 aa		21.8	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	AHCYL1	O43865	530 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CTAG2	O75638	210 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	HLA-H	P01893	362 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NR1H2	P55055	460 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PIGF	Q07326	219 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	BSPH1	Q075Z2	132 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NPRL3	Q12980	569 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PGGHG	Q32M88	737 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	RASSF1	Q9NS23	344 aa		21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	21.79	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	GOSR1	O95249	250 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	HRG	P04196	525 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CD3E	P07766	207 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CTLA4	P16410	223 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	IGFBP5	P24593	272 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	GINS1	Q14691	196 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	ETFDH	Q16134	617 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	MDP1	Q86V88	176 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	LNX2	Q8N448	690 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	TSSK2	Q96PF2	358 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	CIB1	Q99828	191 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NUAK2	Q9H093	628 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	RNF121	Q9H920	327 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		21.78	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	RAB36	O95755	333 aa		21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	IFNG	P01579	166 aa		21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	NPR2	P20594	1047 aa		21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	GSG1	Q2KHT4	349 aa		21.77	■■□□□ 1.08
GPS1-223	ENST00000584229	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		21.77	■■□□□ 1.08

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