RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 CLRN1P58418 232 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM53Q6P2H8 277 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 SLC16A14Q7RTX9 510 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 PFN4Q8NHR9 129 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM255BQ8WV15 326 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ECSITQ9BQ95 431 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 RNF121Q9H920 327 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 C20orf141Q9NUB4 165 aa17.17■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 B4DSR2 109 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 NCR1O76036 304 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 CLPTM1O96005 669 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 PTHP01270 115 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 FAM157BP0CG42 384 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 AQP2P41181 271 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF84P51523 738 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TAS2R41P59536 307 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 MYBPC1Q00872 1141 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 CCNIQ14094 377 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 C10orf128Q5T292 105 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ARMC4Q5T2S8 1044 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 NOXO1Q8NFA2 376 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 CLDND2Q8NHS1 167 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF519Q8TB69 540 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM239Q8WW34 195 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 SGTBQ96EQ0 304 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 CDH20Q9HBT6 801 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 INIPQ9NRY2 104 aa17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 A0A1W2PPW3 197 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 NPIPB13A6NJU9 1138 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 NPIPB4C9JG80 1138 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 WNT9BO14905 357 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 RP2O75695 350 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 THRBP10828 461 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 UCP2P55851 309 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 KLF10Q13118 480 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 LIPNQ5VXI9 398 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 ERICH5Q6P6B1 374 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 HDDC2Q7Z4H3 204 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 RFLNBQ8N5W9 214 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 SYT14Q8NB59 555 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 OR1J2Q8NGS2 313 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 MOSPD2Q8NHP6 518 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 SYNPRQ8TBG9 265 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 C10orf82Q8WW14 230 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 MRGBPQ9NV56 204 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 TAAR3PQ9P1P4 343 aa17.15■□□□□ 0.34
MFGE8-208ENST00000558773 C17orf100A8MU93 164 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 PCMT1P22061 227 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 RAD52P43351 418 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MAGEB1P43366 347 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 OR1E2P47887 323 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 DAP3P51398 398 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SELENOVP59797 346 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 ERVS71-1P61550 626 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 LAPTM4AQ15012 233 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 TBC1D28Q2M2D7 210 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 DEF8Q6ZN54 512 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 TSPAN32Q96QS1 320 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 BCL2L14Q9BZR8 327 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SIAEQ9HAT2 523 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SMURF2Q9HAU4 748 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SAR1AQ9NR31 198 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 GPR160Q9UJ42 338 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa17.14■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 FAM157AC9JC47 383 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MCIDASD6RGH6 385 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MRASO14807 208 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 IFNA14P01570 189 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 TFP02787 698 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 KDELR2P33947 212 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 LMO4P61968 165 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 PLP2Q04941 152 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 ALKBH6Q3KRA9 238 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MMEL1Q495T6 779 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 LRRC18Q8N456 261 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 C11orf40Q8WZ69 217 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 NABP1Q96AH0 204 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 ZNF416Q9BWM5 594 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 LRMDAQ9H2I8 198 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa17.13■□□□□ 0.33
MFGE8-208ENST00000558773 MED31Q9Y3C7 131 aa17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms