RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538095.1

CEP57-208, Transcript of centrosomal protein 57, human

TSL 4

Gene CEP57, Length 590 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP57-208	ENST00000538095	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	RRM2B	Q7LG56	351 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	OR51A7	Q8NH64	312 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FNDC8	Q8TC99	324 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ALG12	Q9BV10	488 aa		13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095		B2RBV5	119 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	PTP4A3	O75365	173 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	RAB36	O95755	333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	T-ENOL	P0DO92	83 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ZNF35	P13682	527 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SERPINF1	P36955	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	LIMS1	P48059	325 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	PIGF	Q07326	219 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	NPRL3	Q12980	569 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	EFNB3	Q15768	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ZBED5	Q49AG3	693 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MEX3D	Q86XN8	651 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SYT14	Q8NB59	555 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ZNF519	Q8TB69	540 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MTOR	P42345	2549 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095		A6NIZ1	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095		B9A039	149 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	DIRAS1	O95057	198 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ATP6V1G2	O95670	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SERPINA5	P05154	406 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ACVR1B	P36896	505 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	GPR4	P46093	362 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	OMP	P47874	163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	GIPR	P48546	466 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SMIM11A	P58511	58 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	RAP1B	P61224	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	RAP1A	P62834	184 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	TNK1	Q13470	666 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	THEM4	Q5T1C6	240 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
CEP57-208	ENST00000538095	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	AHCYL1	O43865	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	CIB2	O75838	187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	CD14	P08571	375 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	OR4A8	P0C604	315 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	NPR2	P20594	1047 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	NR4A1	P22736	598 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	RAB35	Q15286	201 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SEC23B	Q15437	767 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	MTX3	Q5HYI7	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	FGD3	Q5JSP0	725 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	FAM122B	Q7Z309	247 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	FBXO17	Q96EF6	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	RBP7	Q96R05	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SMR3A	Q99954	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	MUC13	Q9H3R2	512 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SIGLEC7	Q9Y286	467 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095		V9GYQ6	96 aa		13.58	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	NDUFB2	O95178	105 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	GADD45G	O95257	159 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CEP57-208	ENST00000538095	SLC2A10	O95528	541 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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