RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 FAHD1Q6P587 224 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ANKRD16Q6P6B7 361 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM122BQ7Z309 247 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 SDR9C7Q8NEX9 313 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 FNDC8Q8TC99 324 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM222BQ8WU58 562 aa11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 HSD17B8Q92506 261 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 RIBC2Q9H4K1 309 aa11.76□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 SLC16A7O60669 478 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 WNT11O96014 354 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 TRIP10Q15642 601 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 SGCAQ16586 387 aa11.75□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 IMPA2O14732 288 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 ARPC3O15145 178 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 EPXP11678 715 aa11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR10A4Q9H209 315 aa11.74□□□□□ -0.53
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PGGT1B-204ENST00000503638 KLHL21Q9UJP4 597 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.74□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R1B8 84 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 BHLHE40O14503 412 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 AHCYL1O43865 530 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 TXNDC12O95881 172 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 F8P00451 2351 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 HLA-DQA2P01906 255 aa11.73□□□□□ -0.53
PGGT1B-204ENST00000503638 OR8G3PP0DMU2 310 aa11.73□□□□□ -0.53
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