RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496372.1

CNIH3-212, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNIH3, Length 451 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-212ENST00000496372 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC22A23A1A5C7 686 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FAM221AA4D161 298 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 H3BN98 237 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 BHLHE40O14503 412 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ARPC3O15145 178 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 AHCYL1O43865 530 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 GOSR1O95249 250 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 WNT11O96014 354 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HRGP04196 525 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 POU1F1P28069 291 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NOS3P29474 1203 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CAPZA2P47755 286 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DAPP51397 102 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF83P51522 516 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TUBA1BP68363 451 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TUBA4AP68366 448 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC36A3Q495N2 470 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 BEX5Q5H9J7 111 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FAHD1Q6P587 224 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TUBA1AQ71U36 451 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF627Q7L945 461 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ADCK1Q86TW2 530 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SVOPLQ8N434 492 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR4K13Q8NH42 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TEX47Q8TBZ9 253 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NSMAFQ92636 917 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HTRA1Q92743 480 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 STMN2Q93045 179 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FOXB1Q99853 325 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 RASSF1Q9NS23 344 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa6.88□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ROS1P08922 2347 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 A0A1W2PPL8 197 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 DPRXA6NFQ7 191 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SLC16A7O60669 478 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 RENP00797 406 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HLA-HP01893 362 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR8G3PP0DMU2 310 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OSMP13725 252 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CTLA4P16410 223 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CDAP32320 146 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NR1H2P55055 460 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KRTAP10-9P60411 292 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 BSPH1Q075Z2 132 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 GINS1Q14691 196 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ETFDHQ16134 617 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SGCAQ16586 387 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 LEG1Q6P5S2 330 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 MDP1Q86V88 176 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SKA3Q8IX90 412 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 LNX2Q8N448 690 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SDR9C7Q8NEX9 313 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR2T33Q8NG76 320 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR52E2Q8NGJ4 325 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SNX18Q96RF0 628 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 NMNAT3Q96T66 252 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SH3GL3Q99963 347 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SYT4Q9H2B2 425 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 RERGLQ9H628 205 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 SEC61A2Q9H9S3 476 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 KRT84Q9NSB2 600 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 B3GNT2Q9NY97 397 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CNIH3-212ENST00000496372 AKAP6Q13023 2319 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms