RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-216ENST00000493752 C9orf135Q5VTT2 229 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 LEG1Q6P5S2 330 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PTCHD4Q6ZW05 846 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 MED12LQ86YW9 2145 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR1K1Q8NGR3 316 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 S100PBPQ96BU1 408 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 DOCK7Q96N67 2140 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 RDH12Q96NR8 316 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 DACH2Q96NX9 599 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FOXB1Q99853 325 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ACTR6Q9GZN1 396 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NUAK2Q9H093 628 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SYT4Q9H2B2 425 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SIAEQ9HAT2 523 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CMC2Q9NRP2 79 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM38BQ9NVV0 291 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 B9D1Q9UPM9 204 aa7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 A1L4Q6 167 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR6C68A6NDL8 312 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR5H1A6NKK0 313 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ZAR1LA6NP61 321 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 H7C1C5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SURF4O15260 269 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC16A7O60669 478 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 RAD51DO75771 328 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC2A10O95528 541 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR8G3PP0DMU2 310 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 EPXP11678 715 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CTLA4P16410 223 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF3P17036 446 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NPR2P20594 1047 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 EPHA2P29317 976 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CCKARP32238 428 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC25A1P53007 311 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 LCN6P62502 163 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 EFNB1P98172 346 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FMODQ06828 376 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TSC22D1Q15714 1073 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 LRRC36Q1X8D7 754 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TBRG1Q3YBR2 411 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FAM27BQ5VT28 67 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 LPCAT4Q643R3 524 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR6V1Q8N148 313 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC22A24Q8N4F4 322 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 WDR31Q8NA23 367 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC37A3Q8NCC5 494 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 OR2T4Q8NH00 348 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 LINC01560Q8TB33 94 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FAM222BQ8WU58 562 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NSMAFQ92636 917 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PTP4A1Q93096 173 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 MUCL1Q96DR8 90 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC38A2Q96QD8 506 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 MED18Q9BUE0 208 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PRRG3Q9BZD7 231 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 RIBC2Q9H4K1 309 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ZNF226Q9NYT6 803 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FKBP7Q9Y680 259 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 A0A096LPE4 126 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 A0A1W2PPZ6 126 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 SH3D21A4FU49 640 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 E9PQ18 207 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 CASKO14936 926 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 FARS2O95363 451 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 ATP6V1G2O95670 118 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 WNT11O96014 354 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 THBDP07204 575 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 B4GALT1P15291 398 aa7.12□□□□□ -1.27
ABCD4-216ENST00000493752 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms