RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TVP23AA6NH52 213 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C11orf98E9PRG8 122 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 H7C2Y5 167 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF264O43296 627 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SPI1P17947 270 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 EDNRAP25101 427 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MST1P26927 711 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 TACR3P29371 465 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DL3P43628 341 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FOXC1Q12948 553 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CHAF1BQ13112 559 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF273Q14593 569 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 HES5Q5TA89 166 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 LCN1P1Q5VSP4 162 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF527Q8NB42 609 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 MNTQ99583 582 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A4Q9H015 551 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 FGF21Q9NSA1 209 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 NLKQ9UBE8 527 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 CTSFQ9UBX1 484 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 ZNF337Q9Y3M9 751 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC4-211ENST00000492996 SDK2Q58EX2 2172 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CPED1A4D0V7 1026 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C2orf72A6NCS6 295 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DCTN6O00399 190 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPANK1O95872 356 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PLGP00747 810 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FBLP22087 321 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IL12BP29460 328 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PPICP45877 212 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SKP2Q13309 424 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GPR50Q13585 617 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MTFR2Q6P444 385 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BEND4Q6ZU67 534 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SETD6Q8TBK2 473 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR14A2Q96R54 314 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACTR6Q9GZN1 396 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RTTNQ86VV8 2226 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PLPP2O43688 288 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DUX1O43812 170 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RNF224P0DH78 156 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PAX1P15863 534 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LTBQ06643 244 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.44e-6■■■■□ 20.5
HERC4-211ENST00000492996 ODF4Q2M2E3 257 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ALG10Q5BKT4 473 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 JAM3Q9BX67 310 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NRIP3Q9NQ35 241 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF835Q9Y2P0 537 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 LINC00862A6NCI5 91 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACOD1A6NK06 481 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 B4DXG7 233 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IL33O95760 270 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AHCYP23526 432 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MAP2K3P46734 347 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MTNR1BP49286 362 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DIO1P49895 249 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACTC1P68032 377 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACTA1P68133 377 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SIRPAP78324 504 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 BDH1Q02338 343 aa6.33□□□□□ -1.4
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