RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491487.1

CIZ1-222, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 2

Gene CIZ1, Length 339 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-222	ENST00000491487	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR52D1	Q9H346	318 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	AURKC	Q9UQB9	309 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ARHGEF9	O43307	516 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NDUFB2	O95178	105 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MPZL1	O95297	269 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RAP2A	P10114	183 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CTLA4	P16410	223 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FPR3	P25089	353 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PTAFR	P25105	342 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GIPR	P48546	466 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CDH11	P55287	796 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	KEAP1	Q14145	624 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MST1L	Q2TV78	715 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RRM2B	Q7LG56	351 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SPATA24	Q86W54	205 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MBD6	Q96DN6	1003 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FBXO17	Q96EF6	278 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ARID1A	O14497	2285 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	IGHV2OR16-5	A0A0B4J2B6	119 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OVOL3	O00110	214 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SOCS2	O14508	198 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FKBP6	O75344	327 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CD79A	P11912	226 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CCL2	P13500	99 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PRKACG	P22612	351 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	DNASE1	P24855	282 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CD47	Q08722	323 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NPRL3	Q12980	569 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TSPAN31	Q12999	210 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RAB39A	Q14964	217 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RFX4	Q33E94	735 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SLC22A25	Q6T423	547 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CDK20	Q8IZL9	346 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LRRC18	Q8N456	261 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NINJ1	Q92982	152 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	DDO	Q99489	341 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TRIM15	Q9C019	465 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FN3K	Q9H479	309 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TIPRL	O75663	272 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SOX14	O95416	240 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TXNDC12	O95881	172 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	WNT11	O96014	354 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CST1	P01037	141 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PSKH1	P11801	424 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CDKN1A	P38936	164 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CAPZA2	P47755	286 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SMIM11A	P58511	58 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RAB1A	P62820	205 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MICA	Q29983	383 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FANK1	Q8TC84	345 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	RADIL	Q96JH8	1075 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZNF570	Q96NI8	536 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	FOXC2	Q99958	501 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ALG12	Q9BV10	488 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	SYT4	Q9H2B2	425 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	EMC7	Q9NPA0	242 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	NGB	Q9NPG2	151 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	F8	P00451	2351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	MED13L	Q71F56	2210 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	PRSS37	A4D1T9	235 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	CENPBD1	B2RD01	187 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CIZ1-222	ENST00000491487	BHLHE40	O14503	412 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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