RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486032.1

COPS3-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 3, humanhuman

TSL 2

Gene COPS3, Length 725 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3-208ENST00000486032 REV1Q9UBZ9 1251 aa4.97□□□□□ -1.61
COPS3-208ENST00000486032 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
COPS3-208ENST00000486032 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.97□□□□□ -1.61
COPS3-208ENST00000486032 A0A1W2PPL8 197 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 A0A1W2PR80 420 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 A6NIZ1 184 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 FAM183AA6NL82 134 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF587BE7ETH6 402 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SLC16A7O60669 478 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RAD51DO75771 328 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 LYZL6O75951 148 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CLDN14O95500 239 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ALPLP05186 524 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CRHP06850 196 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 QDPRP09417 244 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TSPAN19P0C672 248 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 EPHA2P29317 976 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SDHAP31040 664 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CAPZA2P47755 286 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR3A2P47893 321 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 GIPRP48546 466 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RAP1BP61224 184 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ESRRGP62508 458 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RAP1AP62834 184 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PPP2R2BQ00005 443 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 FAM27E3Q08E93 113 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 NPRL3Q12980 569 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 STK11Q15831 433 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ETFDHQ16134 617 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SNAPC1Q16533 368 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 MESTQ5EB52 335 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ARMC4Q5T2S8 1044 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OTPQ5XKR4 325 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ACSM5Q6NUN0 579 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TFAP2EQ6VUC0 442 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 FAM122BQ7Z309 247 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 NOXO1Q8NFA2 376 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR2T33Q8NG76 320 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR6X1Q8NH79 312 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF519Q8TB69 540 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 FBLIM1Q8WUP2 373 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 NRG4Q8WWG1 115 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TMEM45BQ96B21 275 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TSSK2Q96PF2 358 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RBP7Q96R05 134 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 NMNAT3Q96T66 252 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TEX12Q9BXU0 123 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SYT4Q9H2B2 425 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 OR51V1Q9H2C8 321 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 VCXQ9H320 206 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PIGMQ9H3S5 423 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 TOR3AQ9H497 397 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 MED20Q9H944 212 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 CRLF2Q9HC73 371 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 KCNJ16Q9NPI9 418 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ASB6Q9NWX5 421 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 IL20Q9NYY1 176 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 USE1Q9NZ43 259 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 GLTPQ9NZD2 209 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RCE1Q9Y256 329 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 GMPPBQ9Y5P6 360 aa4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.95□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 PTPN13Q12923 2485 aa4.95□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
COPS3-208ENST00000486032 A0A096LPE4 126 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms