RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475470.1

RPUSD3-215, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, human

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A1W2PNR3	127 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	EPX	P11678	715 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	ICAM2	P13598	275 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR2B6	P58173	313 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	SELENBP1	Q13228	472 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	MEP1B	Q16820	701 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	TRIQK	Q629K1	86 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	MFRP	Q9BY79	579 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RPUSD3-215	ENST00000475470	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A087WV48	116 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A1B0GTH9	108 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A1W2PNV4	684 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	PDCD5	O14737	125 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	PIN1P1	O15428	100 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SFTPD	P35247	375 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	MAGEB1	P43366	347 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	BID	P55957	195 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SSPN	Q14714	243 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ORAI1	Q96D31	301 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	FANCF	Q9NPI8	374 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A087WZY1	265 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SNPH	O15079	494 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	MPZL1	O95297	269 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF823	P16415	610 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ATF1	P18846	271 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	FMOD	Q06828	376 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ASAH1	Q13510	395 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	RIN1	Q13671	783 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		Q499Y3	187 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SPATC1	Q76KD6	591 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	UEVLD	Q8IX04	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	HPS1	Q92902	700 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		G3V3Y1	287 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SEC14L5	O43304	696 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	NPR2	P20594	1047 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	DPP4	P27487	766 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	RFX2	P48378	723 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC17A1	Q14916	467 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	KRT77	Q7Z794	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	LIN37	Q96GY3	246 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	GNRHR2	Q96P88	292 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	EMC6	Q9BV81	110 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	BRD7	Q9NPI1	651 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A0C4DFX4	3053 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	C9orf172	C9J069	976 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF432	O94892	652 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SOX2	P48431	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	GPAT4	Q86UL3	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.75	□□□□□ -0.21

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