RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472897.5

RBM3-205, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 5

Gene RBM3, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-205	ENST00000472897	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	DAP	P51397	102 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	MYBPC1	Q00872	1141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	LNX2	Q8N448	690 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PKP2	Q99959	881 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	APC	P25054	2843 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SOCS2	O14508	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SLC2A10	O95528	541 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF23	P17027	643 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	NCMAP	Q5T1S8	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PARP8	Q8N3A8	854 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897		A0A1W2PR80	420 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	DPRX	A6NFQ7	191 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897		H3BN98	237 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897		H7C1C5	153 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SOX14	O95416	240 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	B4GALT1	P15291	398 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	CBR1	P16152	277 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PTAFR	P25105	342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	LCN6	P62502	163 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	FMOD	Q06828	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	SLC36A3	Q495N2	470 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OR4K13	Q8NH42	304 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	NSMAF	Q92636	917 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	DDO	Q99489	341 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RBM3-205	ENST00000472897	ITPR2	Q14571	2701 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SLC16A7	O60669	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SEC14L2	O76054	403 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	REN	P00797	406 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	IGKV3-15	P01624	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	CTLA4	P16410	223 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	CRABP1	P29762	137 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	ARR3	P36575	388 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	GIPR	P48546	466 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	ESRRG	P62508	458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	CDK5	Q00535	292 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	FAM27B	Q5VT28	67 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	LEG1	Q6P5S2	330 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	OR4Q3	Q8NH05	313 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	STMN2	Q93045	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	RADIL	Q96JH8	1075 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	NMNAT3	Q96T66	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	WAC	Q9BTA9	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	KLHL21	Q9UJP4	597 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	UBL3	O95164	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	IGLV1-44	P01699	117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RBM3-205	ENST00000472897	HLA-H	P01893	362 aa		13.69	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms