RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 C11orf87Q6NUJ2 197 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 ELOA3Q8NG57 546 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR4S1Q8NGB4 309 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 OR52R1Q8NGF1 315 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 THAP6Q8TBB0 222 aa12.27□□□□□ -0.44
SH3BP1-206ENST00000469947 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.27□□□□□ -0.44
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SH3BP1-206ENST00000469947 PVRP15151 417 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 PBX2P40425 430 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RBM34P42696 430 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 SQSTM1Q13501 440 aa12.25□□□□□ -0.45
SH3BP1-206ENST00000469947 RAB11BQ15907 218 aa12.25□□□□□ -0.45
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC35D2Q76EJ3 337 aa12.25□□□□□ -0.45
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