RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902		H7C1C5	153 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CRYAA	P02489	173 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FPR3	P25089	353 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ARR3	P36575	388 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RPS6KA3	P51812	740 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LCN6	P62502	163 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	CBX1	P83916	185 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	GSG1	Q2KHT4	349 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	THEM4	Q5T1C6	240 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	C1orf94	Q6P1W5	598 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ZNF627	Q7L945	461 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SKA3	Q8IX90	412 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	FNDC8	Q8TC99	324 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RASD2	Q96D21	266 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	RNF121	Q9H920	327 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	VNN3	Q9NY84	501 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		15.46	■□□□□ 0.07
USP19-210	ENST00000465902	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SOCS2	O14508	198 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SMPD2	O60906	423 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	UBL3	O95164	117 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PPP1R3D	O95685	299 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RAB36	O95755	333 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CELA3B	P08861	270 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CECR9	P0C854	216 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	PATE4	P0C8F1	98 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC6A6	P31641	620 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CDA	P32320	146 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RAB1A	P62820	205 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	TSPAN31	Q12999	210 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SGCA	Q16586	387 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	LRRC18	Q8N456	261 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MBD6	Q96DN6	1003 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SAMD8	Q96LT4	415 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IFT27	Q9BW83	186 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	OR52D1	Q9H346	318 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RERGL	Q9H628	205 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	YY1AP1	Q9H869	796 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	15.45	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PPL8	197 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902		E7EQL1	145 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GAST	P01350	101 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SDHA	P31040	664 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GIPR	P48546	466 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GSS	P48637	474 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FXYD6P3	P58550	94 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NAAA	Q02083	359 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MICA	Q29983	383 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RFX4	Q33E94	735 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MEST	Q5EB52	335 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	C10orf128	Q5T292	105 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAM122B	Q7Z309	247 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FOXC2	Q99958	501 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CRNN	Q9UBG3	495 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	MED13L	Q71F56	2210 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	RTTN	Q86VV8	2226 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC22A23	A1A5C7	686 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	EBAG9	O00559	213 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FKBP6	O75344	327 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	E2F6	O75461	281 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	CIB2	O75838	187 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGKV3-15	P01624	115 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	IGLV1-44	P01699	117 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NPR2	P20594	1047 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	NOS3	P29474	1203 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	FABP6	P51161	128 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		15.43	■□□□□ 0.06
USP19-210	ENST00000465902	SLC36A2	Q495M3	483 aa		15.43	■□□□□ 0.06

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