RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR51V1Q9H2C8 321 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CRLF2Q9HC73 371 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR35Q9HC97 309 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RASSF1Q9NS23 344 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MALT1Q9UDY8 824 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 Q9UFV3 132 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 B9D1Q9UPM9 204 aa8.3□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A31A6NKX4 558 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ENTPD6O75354 484 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GLCEO94923 617 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CGAP01215 116 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV3-9P01782 118 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CTLA4P16410 223 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SPI1P17947 270 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 BMP5P22003 454 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MPGP29372 298 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNB4P30926 498 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HTR1FP30939 366 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCRFS1P47985 274 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH11P55287 796 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RPS7P62081 194 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TGFBR3Q03167 851 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FAPQ12884 760 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CDK5R2Q13319 367 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 APOFQ13790 326 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZT83 130 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NSMAFQ92636 917 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TSSK2Q96PF2 358 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RERGLQ9H628 205 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MED20Q9H944 212 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PRSS50Q9UI38 385 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa8.29□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 A8MXE2 369 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DQA2P01906 255 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 GYPBP06028 91 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NPR2P20594 1047 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC2A5P22732 501 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 EDNRAP25101 427 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LAP3P28838 519 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FMO3P31513 532 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PYCR1P32322 319 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCR4P61073 352 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HSF2Q03933 536 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FMODQ06828 376 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 POU4F2Q12837 409 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 P2RY6Q15077 328 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NRN1LQ496H8 165 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 PHYHD1Q5SRE7 291 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 C6orf141Q5SZD1 244 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 MYO7BQ6PIF6 2116 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 BBS1Q8NFJ9 593 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6K6Q8NGW6 343 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 APH1BQ8WW43 257 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC46Q96FV0 321 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC120Q96HB5 630 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TEAD3Q99594 435 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXB1Q99853 325 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HCAR1Q9BXC0 346 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 SCN3BQ9NY72 215 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOVL5Q9NYP7 299 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 HAO2Q9NYQ3 351 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R16Q9NYV7 291 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
SH3BP4-208ENST00000462602 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PPL8 197 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-208ENST00000462602 IRGMA1A4Y4 181 aa8.27□□□□□ -1.09
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC182A6NF36 153 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms