RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440447.2

PTX4-202, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTX4, Length 1,117 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-202ENST00000440447 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 CAPZA2P47755 286 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 NR1H2P55055 460 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 FAHD1Q6P587 224 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 OR2T33Q8NG76 320 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 NSMAFQ92636 917 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 STMN2Q93045 179 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 PLPPR2Q96GM1 343 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 PKP2Q99959 881 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa15.98■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 TMEM38BQ9NVV0 291 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 REV1Q9UBZ9 1251 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15.98■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 SIAH2O43255 324 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 RENP00797 406 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 POU1F1P28069 291 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 DAPP51397 102 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 SLC36A3Q495N2 470 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 LEG1Q6P5S2 330 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa15.97■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 ICA1LQ8NDH6 482 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 OR4K13Q8NH42 304 aa15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PTX4-202ENST00000440447 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 M0R1B8 84 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 NPR2P20594 1047 aa15.96■□□□□ 0.15
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PTX4-202ENST00000440447 SLC16A7O60669 478 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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PTX4-202ENST00000440447 CD79AP11912 226 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 CRABP1P29762 137 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 CDAP32320 146 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
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PTX4-202ENST00000440447 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SKA3Q8IX90 412 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SH3GL3Q99963 347 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTX4-202ENST00000440447 KRT84Q9NSB2 600 aa15.95■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.95■□□□□ 0.14
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PTX4-202ENST00000440447 CTLA4P16410 223 aa15.94■□□□□ 0.14
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PTX4-202ENST00000440447 GINS1Q14691 196 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 ETFDHQ16134 617 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 PGGHGQ32M88 737 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 SLC16A14Q7RTX9 510 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 MDP1Q86V88 176 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 CDC20BQ86Y33 519 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 PARP8Q8N3A8 854 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.94■□□□□ 0.14
PTX4-202ENST00000440447 HTRA1Q92743 480 aa15.94■□□□□ 0.14
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