RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 FAM3DQ96BQ1 224 aa15.26■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.26■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 FRG2CA6NGY1 282 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 D6RAR5 112 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TGFBR3LH3BV60 316 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 XKRYO14609 159 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 ARPC5O15511 151 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 DOK2O60496 412 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 OR2F2O95006 317 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CD74P04233 296 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 RLN1P04808 185 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF35P13682 527 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 HLA-GP17693 338 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MPGP29372 298 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SOX2P48431 317 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 POU3F4P49335 361 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CCR5P51681 352 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MAP2K6P52564 334 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 H2BFSP57053 126 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 OR2F1Q13607 317 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GRM7Q14831 915 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PHF19Q5T6S3 580 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 NKAIN2Q5VXU1 208 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM81Q6P7N7 255 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 OR6S1Q8NH40 331 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PBX4Q9BYU1 374 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CAPN10Q9HC96 672 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SLC2A8Q9NY64 477 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 DTX4Q9Y2E6 619 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SCN2AQ99250 2005 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM131Q92545 1883 aa15.25■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 EML5Q05BV3 1969 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 AKR7A3O95154 331 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 HRGP04196 525 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SLC25A4P12235 298 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 RAB6AP20340 208 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 DRD1P21728 446 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PBX2P40425 430 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 KIR3DL2P43630 455 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 RAB12Q6IQ22 244 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 ARSKQ6UWY0 536 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GABRG1Q8N1C3 465 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PRSS35Q8N3Z0 413 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MRGPRX1Q96LB2 322 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MOGAT1Q96PD6 335 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 EDEM2Q9BV94 578 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CDCP1Q9H5V8 836 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 EXO5Q9H790 373 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TRAV18A0A075B6X5 111 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 A0A1B0GTI1 187 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 H0Y8X5 98 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM77I1YAP6 450 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GOSR2O14653 212 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SDC3O75056 442 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 BGLAPP02818 100 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 CLPSP04118 112 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MAS1P04201 325 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 ST6GAL1P15907 406 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GRPRP30550 384 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 BLKP51451 505 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 EGR4Q05215 589 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SGCBQ16585 318 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 WDR38Q5JTN6 314 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 Q6ZSR6 202 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 OR5M1Q8NGP8 315 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 LINC00052Q96N35 136 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MFFQ9GZY8 342 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GPR27Q9NS67 375 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 MSRAQ9UJ68 235 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 PLCL2Q9UPR0 1127 aa15.24■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa15.23■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM82A0PJX8 343 aa15.23■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 SCO1O75880 301 aa15.23■□□□□ 0.03
HCLS1-202ENST00000428394 HPP00738 406 aa15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms