RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 NUAK2Q9H093 628 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SYT4Q9H2B2 425 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RERGLQ9H628 205 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SIAEQ9HAT2 523 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 B9D1Q9UPM9 204 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KNTC1P50748 2209 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR5H15A6NDH6 313 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TVP23AA6NH52 213 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A6NL46 340 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF726A6NNF4 738 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NKX2-8O15522 239 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NEURL1O76050 574 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 TFP02787 698 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KRT8P05787 483 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 RFPL3SP0C7P2 107 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 HLA-DOBP13765 273 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF43P17038 809 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 GALP22466 123 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 OR12D2P58182 307 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CLRN1P58418 232 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 ARG2P78540 354 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 GLO1Q04760 184 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 CCDC58Q4VC31 144 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TP53I3Q53FA7 332 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A25Q6KCM7 469 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ARL9Q6T311 187 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FAM220AQ7Z4H9 259 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KRT77Q7Z794 578 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 TIGD4Q8IY51 512 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KDM8Q8N371 416 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MS4A15Q8N5U1 240 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZFP41Q8N8Y5 198 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR6N2Q8NGY6 317 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 OR6X1Q8NH79 312 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SVIPQ8NHG7 77 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MCFD2Q8NI22 146 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FNDC8Q8TC99 324 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 C17orf50Q8WW18 174 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNRF4Q8WWF5 429 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ASB17Q8WXJ9 295 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM203Q969S6 136 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KCTD7Q96MP8 289 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CENPOQ9BU64 300 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 TMED9Q9BVK6 235 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 RNF32Q9H0A6 362 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MMP27Q9H306 513 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 WDR76Q9H967 626 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 MARCH7Q9H992 704 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 LAMP5Q9UJQ1 280 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 GNG8Q9UK08 70 aa5.93□□□□□ -1.46
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HDAC8-211ENST00000415409 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 PTPRBP23467 1997 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 FAM208BQ5VWN6 2430 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0J9YW62 118 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 METTL15A6NJ78 407 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPA2E9PIF3 369 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 NPIPA3F8WFD2 350 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 DCTN6O00399 190 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC8-211ENST00000415409 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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