RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF544Q6NX49 715 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 B3GLCTQ6Y288 498 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GALNT10Q86SR1 603 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 OR52R1Q8NGF1 315 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FAM45AQ8TCE6 357 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ABHD3Q8WU67 409 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 HBEGFQ99075 208 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CPNE1Q99829 537 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FAM234AQ9H0X4 552 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NARFLQ9H6Q4 476 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FKRPQ9H9S5 495 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MED29Q9NX70 200 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CD274Q9NZQ7 290 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PRODH2Q9UF12 536 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PLLPQ9Y342 182 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ASB4Q9Y574 426 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 PLXNB1O43157 2135 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0A6YYD5 115 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 A0A1W2PP11 408 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA6L10A6NI86 522 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 B4DXG7 233 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 C9JVG2 144 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TAPBPO15533 448 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SPRY3O43610 288 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 B3GALNT1O75752 331 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 IGHV2-70P01814 119 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 UROSP10746 265 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 S1PR1P21453 382 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 DRD5P21918 477 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SERPINB1P30740 379 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GABRA5P31644 462 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GAS1P54826 345 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CDKL1Q00532 357 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CUL3Q13618 768 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 LTB4RQ15722 352 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF626Q68DY1 528 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 UGT2A3Q6UWM9 527 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MARCH3Q86UD3 253 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 NUDT13Q86X67 352 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 VSTM4Q8IW00 320 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TCAIMQ8N3R3 496 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 FADS6Q8N9I5 356 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 OSTF1Q92882 214 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB9Q96C00 473 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MTBPQ96DY7 904 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 DUX5Q96PT3 197 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SLC6A7Q99884 636 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 KCNS3Q9BQ31 491 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ANKRA2Q9H9E1 313 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CDH20Q9HBT6 801 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TIGARQ9NQ88 270 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 MAT2BQ9NZL9 334 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 SENP1Q9P0U3 644 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ASIC3Q9UHC3 531 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0J9YW62 118 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 OR5H1A6NKK0 313 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 B4DSR2 109 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 GPR137BO60478 399 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN2O60636 221 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 BANF1O75531 89 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 STAMBPO95630 424 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRK-210ENST00000415055 CH25HO95992 272 aa3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms